基因组多态性.ppt

基因组多态性;基础要求;;人与人差异根源是什么？;黑猩猩与人基因差异只有1%;药效差异原因是基因多态性; 人类基因组共性(99.9%): 决定发育成一个人: 人类基因组多态性（0.1%): 决定发育成某一个具体人: 身高、容貌、行为、健康、患某种病、寿命等。;OMIM Statistics for October 19, 2011 (Online Mendelian Inheritance in Man);人类基因组: 24条染色体/31亿碱基对;人类基因组包含: 细胞核基因组: 规模庞大。 线粒体基因组: 仅37个基因。;细胞核基因组 24条染色体上全部遗传信息, 包含: 编码次序:结构基因3～4万个 非编码次序: 基因内插入次序、反复次序、基因间间隔次序等;结构基因;Exon;Flanking Sequence;TATA box;GC box G G C G G G;CAAT box;Regulator Sequence;逆转录;基因组多态性概念;遗传学标识是一类能够区分不一样个体和 群体,或者能够区分不一样染色体位点, 同时又能稳定遗传物质。 宏观可见或微观存在。 ;基因组多态性种类; ;DNA酶切后在同一电泳场中移动差异; ; RFLP遗传基础: 限制性内切酶含有特异识别序列和切点, 如: ApaI 识别序列和切点为: 5’GGGCC^C 3’, BamHI识别序列和切点为: ? 5’G^GATCC 3’。; 不一样个体DNA分子存在部分碱基差异, 如 果这种差异恰好位于某种限制性内切酶特 异性识别序列上, 将会失去或增加一个酶切 位点, 从而改变酶切后形成特定DNA片段 大小。 通常能够引发酶切位点变异突变, 如点突 变、DNA片段插入或缺失等均可造成RFLP 产生。;1980年代, 用内切酶切割DNA后电泳, 发觉人类基因组一些位点含有多个等位 基因, 称为人类基因组高变区 （hypervariable rigion, HVR) , 即小卫星DNA。;由部分约十多个或几十个bp短序列 （即反复单位）串联反复而成。如: GGTTCTTAAAAAGGTTCTTAAAAA------GGTTCTTAAAAAGGTTCTTAAAAA 不一样个体或同一个体两条同源染色 体之间, 反复次数可能并不相同。 区分于存在于着丝粒、端粒和Y长臂反复序列, 称为小卫星DNA。;小卫星DNA特点 1、同一HVR反复单位含有高度保守性。 2、在不一样个体或同一个体同源染色体之 间, 反复单位反复次数不一样, 组成众多等 位基因。 3、经酶切、电泳、变性、印迹、反复序列 杂交、冲洗、显影后表现为丰富多彩 RFLPs。;4、同一个体不一样组织起源RFLP谱带完全一样; 而不一样个体谱带位置和宽度千差万别, 可称为DNA指纹。 5、每一条谱带遗传均遵照孟德尔规律。大部分谱带以杂合状态存在。 HVR是多态信息含量较高分子标识。;HVR谱带在人与人之间差异就象人指 纹一样, 故将其称为DNA指纹。尤如商品条形 码, 千差万别, 丰富多彩。 比如, 用α珠蛋白3’HVR关键序列探针所显示 DNA指纹, 个体相关机率为4×10-12,意味着现今世界上除同卵双生外没 有DNA指纹相同人。;小卫星DNA非单倍型遗传; 1、Southern bloting(RFLP法）: 酶切、电泳、变性、印迹、杂交、冲洗、显影。得到多条泳带图谱, 每一谱带代表一个位点探针互补序列反复次数。 2、AMP---FLP法（单位点）: 即PCR扩增片段长度多态性方法: 引物合成、PCR、电泳、染色。得到一条或二条带, 仅代表一个位点反复序列, 是纯合子或杂合子。;法医学方面——个体识别 现场检材和嫌疑对象DNA指纹条带位置与强度一致, 则为同一个体。 亲子判定: 如能从父母指纹中找到孩子全部条带, 亲子关系成立。; 概 念 人类基因组间隔序列和内含子等非编码 区内, 广泛存在着与小卫星DNA相同重 复单位为1～6bp短小反复序列, 称为微卫星DNA。也称为短串联反复序列 （short tandem repeats,STR), 如: （GACA)n、(GATA)n、(TCC)n 、(CT)n、 (CA)n。;1、在人类基因组中出现数目和反复次数不一样, 表现高度多态性。 2、是分散排列简单反复序列。每10kbDNA中可能有一个微卫星DNA, 约占基因组10%。 3碱基或4碱基微卫星DNA, 突变率低, 试验中稳定性好, 易于标准化, 更受大家重视。;微卫星DNA