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- 2022-05-25 发布于广东
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网络药理学方法预测半夏泻心汤治疗抑郁症和溃疡性结肠炎的药理作用机制研究
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正文 1
文1:网络药理学方法预测半夏泻心汤治疗抑郁症和溃疡性结肠炎的药理作用机制研究 1
文2:观察百合地黄汤对抑郁症小鼠的药理作用 11
1 材料与方法 11
2 结果 12
3 讨论 13
参考文摘引言: 15
原创性声明(模板) 16
文章致谢(模板) 17
正文
网络药理学方法预测半夏泻心汤治疗抑郁症和溃疡性结肠炎的药理作用机制研究
文1:网络药理学方法预测半夏泻心汤治疗抑郁症和溃疡性结肠炎的药理作用机制研究
抑郁症是一种慢性反复发作的精神障碍性疾病,患者以显著而持久的心境低落为主要临床特征,同时常伴有以胃肠道疾患为主诉的躯体症状。溃疡性结肠炎是由多种致病因素共同作用而引发的慢性消化道疾病。两种疾病的发病特征具有病因复杂、病证多样化、病程迁延等特点,即抑郁症患者常会导致胃肠道功能紊乱并抑制患者内脏活力、降低胃肠动力及促进溃疡发生,严重者还可导致肠道组织癌变,同时抑郁情感症状还会导致患者相关胃肠道神经调节功能和运动能力发生异常,如出现食欲减退、便秘、腹胀、腹泻等,这些胃肠症状又会加重患者的焦虑抑郁情绪;慢性反复发作的炎性肠道病变患者本身产生的功能障碍就容易造成患者产生焦虑抑郁等症状,这些不良情绪亦会影响溃疡愈合与疾病康复,甚至还会导致恶性循环,加剧疾病的损害[1,2,3]。传统中医药在治疗抑郁症和溃疡性结肠炎方面具有整体调节与安全有效的独特优势,临床实践基础深厚,同时还积累了大量的治病经方,因而被广泛关注。
半夏泻心汤首载于《伤寒杂病论》,方由半夏、干姜、黄芩、黄连、人参、甘草、大枣7味中药组成,具有调节寒热、辛开苦降、补脾益胃、散结除痞、攻补兼施之功效,为调节在里之枢病的主方。现代临床常用该方来治疗寒热错杂、虚实夹杂、胃肠功能紊乱的患者,同时该方还可用于治疗抑郁症患者伴见脘腹胀满、纳少、便溏等胃肠道症状皆取得较好的临床疗效[4,5]。前期传统中医临证经验、现代临床实践及动物实验[6,7]皆表明,该方通过各药物间“成分协同”“靶标协作”“药效协奏”等作用方式来有效发挥中医药“异病同治”“脏腑同治”“标本同治”的综合优势,但目前针对其药效物质基础与分子作用机制方面尚缺乏全面系统的认识,因此本研究旨在运用网络药理学生物模块分析的方法,筛选出半夏泻心汤中草药的活性成分及预测靶标,更深入地理解经方在异病同治过程中所作用的关键通路与作用机制,进而全方位、多层面、系统化探究经方的多靶点效应机制、异病同治的生物机制、整体调治的关联机制,为接下来的实验验证、临床应用、新药研发等方面提供可靠的参考价值。
资料与方法
1.筛选半夏泻心汤活性成分与预测靶标半夏泻心汤含半夏、黄芩、黄连、人参、干姜、大枣、甘草7味中药,运用中医药自主知识产权在线开源数据库——中医药百科全书平台[8,9]获取化合物与预测靶标,将所获取的草药活性成分与相关文献相结合予以分析,再运用UniProt(http:)数据库中UniProtKB搜索功能,输入筛选出的预测靶标蛋白名称并限定物种为HomoSapie,并将靶标蛋白校正为官方名称(OfficialSymbol)
2.获取疾病靶标利用基因疾病关联数据库(DisGeNET)、人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM)、药物靶标数据库(DrugBank)、比较毒物基因组数据库(CTD)、遗传药理学与药物基因组学(PharmGKB)的疾病数据库,以“DepressiveDisorder”“Depression”“UlcerativeColitis”作为关键词,检索与筛选两种疾病靶标,合并各疾病数据库靶基因,剔除重复靶标,最终获取抑郁症和溃疡性结肠炎发病过程已知的疾病靶标。
3.构建“药物-疾病”交集靶标数据库将所筛选的草药靶标与疾病靶标分别导入到OmicShare工具中生成维恩图,映射得到半夏泻心汤治疗抑郁症和溃疡性结肠炎的共同作用靶基因,合并抽取交集靶基因,最终提取出草药对疾病共同作用的靶标蛋白数据库。
4.构建蛋白交互网络将上述交集靶标导入STRING平台,构建并阐明靶蛋白相互作用的网络,物种选择“HomoSapie”,阈值选择“MediumConfidence”,获取靶标蛋白-蛋白相互作用关系数据列并保存.TSV格式文件,获取蛋白交互网络图形。
,运用MCODECluster插件,构建关键的网络模块;所构建的各网络模块通过运用注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)在线工具对关键网络模块中所含的靶基因进行基因本体(GO)生物过程和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,采用改进的Fisher精确检验算法得到各个功能及通路P值
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