重度抑郁症应用柴胡疏肝散辅助治疗的网络药理学研究.docVIP

重度抑郁症应用柴胡疏肝散辅助治疗的网络药理学研究 目录 TOC \o 1-9 \h \z \u 目录 1 正文 1 文1：重度抑郁症应用柴胡疏肝散辅助治疗的网络药理学研究 1 1、材料与方法 2 2、结果 4 3、讨论 6 文2：TIP辅助治疗重度抑郁症发作的临床疗效 8 参考文摘引言： 9 原创性声明（模板） 11 文章致谢（模板） 11 正文 重度抑郁症应用柴胡疏肝散辅助治疗的网络药理学研究 文1：重度抑郁症应用柴胡疏肝散辅助治疗的网络药理学研究 重度抑郁症（MDD）是一种具有高发病率、高复发率、高共病率和高自杀率等特点的情绪性功能障碍疾病[1]，主要临床表现为情绪抑郁、易疲劳、兴趣丧失、精力减退、注意力下降、决策力受损、反应迟钝等。目前，该病的主要治疗方式有药物治疗、物理治疗及心理治疗等[2]。以选择性5-羟色胺再吸收抑制剂为代表的一线抗抑郁药，可以有效缓解抑郁症患者的愤怒情绪和攻击性行为，但也存在副作用[3]。相关研究发现，中药辅助治疗重度抑郁症，可减轻抗抑郁药物的副作用，提高患者的依从性及治愈率，如柴胡疏肝散联合推拿治疗脑卒中后重性抑郁障碍，其治疗有效率可达90%[4]；另外，利用柴胡疏肝散颗粒能降低抑郁症患者的汉密尔顿抑郁量表评分，改善其日常生活能力及抑郁状态，提高其血清脑源性神经营养因子水平[5]。这表明柴胡疏肝散对MDD有一定的辅助治疗作用，但其治疗MDD的潜在分子机制尚不明确。 中药网络药理学通过“网络靶向多组分”的模式进行研究，可预测中药化合物的靶向分布和药理作用，揭示药物-基因-疾病网络关系，能高效率地从中药复方中筛选出多种活性成分，更好地诠释中药方剂的组合规律和网络调节效应[6]。本研究在中药复方多成分、多靶标、多途径作用的研究思路上，基于中药网络药理学技术，构建“柴胡疏肝散活性成分-MDD靶标基因”关系网络，探讨柴胡疏肝散治疗MDD的潜在分子机制，以期为该方剂后续研究及应用提供参考。 1、材料与方法 患者基因表达谱芯片数据的获取 本研究从基因表达综合数据库（GEO，https：./gds/）中下载序列号为GSE76826的基因芯片数据矩阵文件。该数据矩阵文件是将年龄≥50岁的32例人体血液转录组样本通过Agilent-039494SurePrintG3HumanGEv28x60KMicroarray039381探针进行试验处理而得的。该数据矩阵文件中包含对照组12例，为健康个体血液样本的基因表达谱芯片数据；试验组20例，为MDD患者血液样本的基因表达谱芯片数据。 患者差异基因的筛选 使用R语言软件（版本：.0）中的limma包对MDD患者的差异基因进行筛选。limma包可对RNA测序（RNAseq）数据执行差异表达和差异剪接分析[7]。本研究差异基因的筛选条件为，其中log2FC为上调，log2FC-为下调[8，9]，然后根据筛选出的差异基因绘制火山图。 柴胡疏肝散活性成分的筛选及靶标预测 利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP，http：）研究柴胡疏肝散和靶点的相互关系。以生物利用度（OB）≥30%和类药性（DL）≥为条件[10，11]筛选出柴胡疏肝散（由柴胡、陈皮、甘草、白芍、川芎、香附、枳壳组成）中每味中药的活性成分；同时，查询获得柴胡疏肝散所有活性成分对应的靶标，然后通过UniProt数据库（https：）对靶标进行基因注释，获取各个靶标对应的基因ID。 构建“柴胡疏肝散活性成分-MDD靶标基因”关系网络 (https：.esools/venny/）对MDD差异基因和柴胡疏肝散活性成分对应的靶标基因取交集，获取MDD与柴胡疏肝散的共同靶标基因，即柴胡疏肝散治疗MDD的作用靶标基因。为了解药物活性成分与疾病靶标基因之间的作用关系，将共同靶标基因与药物活性成分编排成关系对文件，，得到“柴胡疏肝散活性成分-MDD靶标基因”关系网络。 蛋白互作（PPI）网络的构建及拓扑分析 为了解各个靶标基因之间的相互作用关系，，使用集网络构建、可视化和分析功能于一体的生物信息学工具BisoGenet插件[12]构建PPI网络。通过CytoN-CA插件对构建的PPI网络进行拓扑分析，计算Betweenness(BC）值，设置BC的最小值为600[13，14，15]，筛选出核心靶标基因，构建PPI核心子网络。 基因集富集分析 为了筛选出的核心靶标基因在MDD中富集的生物学通路及潜在的作用机制。通过GSEA算法[16，17]，剔除掉正常样本后，根据每个靶标基因在MDD患者样本中表达量的中位值，分别定义了靶标基因的高表达组和低表达组两个表型，然后基于基因表达数据与靶标基因高、低表型的关联度大小进行排序，判断每个京都基因与基因组百科全书（KEGG）功能基因集内