生物化学参考吴旭日 第二章 蛋白质化学.pptVIP

α-螺旋的结构特征： 1) 右手螺旋；每隔3.6个AA残基螺旋上升一圈，螺距0.54nm， 0.15nm/AA; 肽键平面与螺旋长轴平行； 2 ) 每个氨基酸残基的N-H与前面第四个氨基酸残基的C=0形成氢键，肽链上所有的肽键都参与氢键的形成，因此，氢键是α-螺旋稳定的主要次级键。 3) 螺旋体中所有氨基酸残基R侧链都伸向外侧，其形状、大小及电荷等均影响α-螺旋的形成和稳定； 如：（1）连续酸碱AA；（2）较大的AA残基；（3）有Pro 或羟脯氨酸残基 多态性：多数为右手（较稳定），亦有少数左手螺旋存在（不稳定）；存在尺寸不同的螺旋。 3. ?-折叠 (?-pleated sheet) 两段以上的折叠成锯齿状的肽链，通过氢键相连而平行成片层状的结构称为β-折叠或称β-片层。 β-折叠的结构特征: 成锯齿状； 肽链平行排列，链间氢键是维持结构的主 要次级键； 有顺式和反式两种走向，反式更稳定； 氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下； 分子量小且不带同种电荷的氨基酸较易形成 ， 如：Gly, Ala等。 4. ?-转角(β-turn) 蛋白质分子中，肽链经常会出现180°的回折，在这种回折角处的构象就是β-转角或称β-折角(β-blend)。 β-转角中，第一个氨基酸残基的C＝O与第四个残基的N-H形成氢键，从而使结构稳定。 5. 无规线团 无规线团(卷曲)或卷曲：泛指那些不能被归入明确的二级结构如折叠或螺旋的多肽区段。 无规线团并不是完全无规的。这些“无规线团”也像其它二级结构那样是明确而稳定的结构，否则蛋白质就不可能形成三维空间上的每维都具周期性结构的晶体。但是它们受侧链相互作用的影响很大。这类有序的非重复性结构经常构成酶活性部位和其它蛋白质特异的功能部位。 无规则卷曲 细胞色素C （三）基序（motif ) 基序又称超二级结构是指在多肽链内顺序上相互邻近的二级结构常常在空间折叠中靠近，彼此相互作用，形成规则的，在空间上能辨认的二级结构聚集体。 它们可作为三级结构的“建筑块”或结构域的组成单位，是蛋白质构象中二级结构与三级结构之间的一个层次。 目前发现的超二级结构有三种基本形式：α螺旋组合(αα)；β折叠组合(βββ)和α螺旋β折叠组合(βαβ)，其中以βαβ组合最为常见。 αα：由两股或三股右手α螺旋彼此缠绕而成。例如：α角蛋白，肌球蛋白，纤维蛋白原中的超二级结构。 βββ：由β折角和回形拓扑结构形成的超二级结构。 βαβ：最常见的βαβ组合是由三段平行的β链和二段α螺旋链构成。 （三）蛋白质的三级结构（ tertiary structure of protein ） 蛋白质的三级结构(tertiary structure)是指多肽链中所有原子或基团的空间排列，也就是多肽链在二级结构的基础上，由氨基酸残基侧链基团的相互作用使多肽链进一步盘旋或折叠，导致整个分子形成不规则的特定构象。 蛋白质三级结构的稳定主要靠次级键，包括氢键、疏水键、盐键以及范德华力等。 1、主要次级键：　 溶菌酶的三级结构 2、结构域： 蛋白质三维折叠中的一个层次，主要是相邻的二级结构片段集装在一起形成超二级结构，在此基础上，进一步折叠成近乎球状，相对独立的三维结构实体，这个区域称为结构域。 注解： 1）超二级结构和三级结构间的一个层次； 2）在蛋白质的三级结构内的独立折叠单元； 3）通常都是由几个超二级结构单元的组合； 4）一般由100-200 AA组成 IgG的结构域示意图 免疫球蛋白(IgG)由12个结构域组成，其中两个轻链上各有2个，两个重链上各有4个；补体结合部位与抗原结合部位处于不同的结构域。 （四）蛋白质的四级结构 1、亚基(subunit)：由两条或多条肽链构成，链间由非共价键维系，每条肽链都有自己的一、二、三级结构，这种蛋白质的每条肽链被称为一个亚基。 亚基本身都具有三级结构，一般只包含一条多肽链，也有由二条或二条以上由二硫键连接的肽链组成的。 2、四级结构(quarternary structure): 是指由相同或不同的亚基按照一定排布方式以非共价键相连而形成的更复杂的构象。 维持四级结构稳定的主要作用力是疏水键 一级结构 二级结构 三级结构 四级结构 定义 形式 开链(有/无分支) 环状多肽 α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规线团 二级结构、基序、结构域 亚基 键 肽键 氢键 次级键 疏水键 三、蛋白质和多肽合成的基本原理 化学合成法 （自学） 1 半合成法 2 生物合成法 3 基因工程（genetic engineering)