生物化学参考第二节 核酸的分子结构.pptVIP

第二节  核酸的分子结构 一、DNA的分子结构 （一） DNA的一级结构 DNA是由数量庞大的四种脱氧核糖核苷酸通过3’,5’-磷酸二酯键连接起来的直线形或环形多聚体。 DNA没有侧链，只有两个末端分别称为5’-末端(5’-P)和3’-末端(3’-OH)。DNA链具有方向性，书写时方向5’→3’ 表示一个核酸分子结构的方法由繁至简有许多种。由于核酸分子结构除了两端和碱基排列顺序不同外，构成核苷酸单元的戊糖和磷酸基是相同的。体现核苷酸差别的实际上只是它所带的碱基。因此，在核酸分子结构的简式表示方法中，仅须注明一个核酸分子的哪一端是5’末端，哪一端是3’末端，末端有无磷酸基，以及核酸分子中的碱基顺序即可。如未特别注明5’和3’末端，一般约定，碱基序列的书写是由左向右书写，左侧是5’-末端，右侧为3’-末端。 说明： (1) P代表磷酸基 (2) A,C,T,G代表相应的碱基 (3) 竖线表示核糖的碳链，从上端到下端分别是1’→5’ (4)竖线一端1’与碱基相连，另一端5’与P相连 (5) 中间斜线3’与P相连 2. 文字式 pApCpTpG or pACTG (1) P代表磷酸基 (2) A,C,T,G代表相应的碱基 (3) P在左表示与5’端相连 (4) P在右表示与3’端相连，有时可省略 DNA的一级结构就是构成DNA的各个单核苷酸之间连接键的性质以及核苷酸的数目和排列顺序。 短的核酸链(≤50)称为寡核苷酸(oligonucleotide)， 更长的核酸链称为多核苷酸(polynucleotide)。 生物的遗传信息就储存记录在DNA的核苷酸序列中。测定DNA的一级结构，也就是测定DNA的核苷酸序列。 （二）真核细胞DNA和原核细胞DNA 的一级结构特点 在一级结构上真核细胞DNA具有以下显著特点： 1．重复顺序 真核细胞染色质DNA具有许多重复排列的核苷酸序列，称为重复顺序。按重复程度不同可分为高度重复顺序，中度重复顺序和单一顺序三种。 （1）高度重复顺序： 许多真核细胞染色质DNA都含有高度重复顺序。这种重复顺序结构的“基础顺序”短，含5~100bp，重复次数可高达几百万次（106~107）。高度重复顺序结构中G-C含量高，进行CsCl梯度离心时常在DNA主峰旁显示一个或多个小峰，这些小峰称为卫星峰，这部分DNA又称为卫星DNA。这种DNA的GC含量一般少于主带中的DNA。浮力密度也低。 （2）中度重复顺序： 这种结构的“基础顺序”长，可达300bp或更长，重复次数从几百到几千不等。 组蛋白基因，rRNA基因（rDNA）及tRNA基因（tDNA）大多数为中度重复顺序。 （3）单一顺序： 又称单拷贝顺序，真核细胞中，除组蛋白外，其他所有蛋白质都是由DNA中单一顺序决定的。每一序列片段决定一个蛋白质，为一个蛋白质的结构基因。 迄今为止，在真核生物中还没有发现一个蛋白质基因是多顺反子结构的。 2．间隔顺序与插入顺序 在真核细胞DNA分子中，除了编码蛋白质和RNA的基因序列片段外，还有一些片段不编码任何蛋白质和RNA，它们可以存在于基因与基因之间，也可以存在于基因之内。 存在于基因与基因之间的称为间隔顺序，存在于基因内的称为插入顺序。 在许多DNA分子中，常常含有长短不一的间隔顺序，也常常出现一些插入顺序将一个基因分成几段。如鸡卵清蛋白基因，珠蛋白基因都含有插入顺序。 通常把基因内的插入顺序称为内含子（intron），把编码蛋白质的基因顺序称为外显子（exon）。 3．回文结构 在真核细胞DNA分子中，还存在许多特殊的序列。这种结构中脱氧核苷酸的排列在DNA两条链中的顺读与倒读意义是一样的（即脱氧核苷酸正反排列顺序相同），脱氧核苷酸以一个假想的轴成为180°旋转对称（即使轴旋转180°后，两部分能完全重合），这种结构称为回文结构。 TAGCTA ATCGAT 原核生物DNA顺序组织具有不同特点： 1．原核生物在DNA顺序组织上的最大特点是基因重叠。也就是说在同一DNA序列中，常包括不同的基因区，这些重叠在一起的基因，使用的编码组序不同，因此虽然是同样的DNA顺序区段内，都可翻译出不同的蛋白质。 如病毒DNA分子一般都不大，但又必须装入相当多的基因，因此可能在这种压力下导致病毒DNA在进化过程中重叠起来。 由于基因的重叠，在重叠部位一个碱基的突变将影响两个或三个蛋白质的表达。 如在噬菌体ΦX174中，基因B和基因K重叠在基因A之内。由下图可见在同一部分核苷