黄花倒水莲内生真菌活性鉴定及基因组测序分析.pdfVIP

目录 摘要I Abstract III 目录VI 第1 章 绪论 1 1.1 黄花倒水莲概述 1 1.1.1 生物学特性 2 1.1.2 化学成分研究 2 1.1.3 生物活性研究 3 1.2 植物内生真菌研究进展 4 1.2.1 内生真菌的定义 4 1.2.2 内生真菌的生物学作用 4 1.2.3 内生真菌代谢产物的作用 6 1.3 真菌次级代谢产物预测 8 1.4 研究目的与意义 9 第2 章 黄花倒水莲内生真菌活性鉴定 10 2.1 实验材料 10 2.1.1 供试材料 10 2.1.2 培养基 10 2.1.3 试剂 10 2.1.4 器材 11 2.2 方法 11 2.2.1 内生真菌的活化 11 2.2.2 内生真菌抑菌活性菌株初筛 11 2.2.3 内生真菌抑菌活性菌株复筛 11 2.2.4 内生真菌抗氧化活性测定 12 2.2.5 HNLF-5 和HNLF-44 菌株发酵物的获取及抑菌活性测定 12 2.2.6 HNLF-5 和HNLF-44 菌株发酵液对种子萌发的影响 13 2.2.7 HNLF-5 和HNLF-44 菌株的鉴定 14 2.3 结果与分析 14 2.3.1 内生真菌抑菌活性初筛结果 14 2.3.2 内生真菌抑菌活性复筛结果 17 2.3.3 内生真菌抗氧化活性结果 19 2.3.4 HNLF-5 和HNLF-44 菌株发酵物抑菌活性结果 22 2.3.5 HNLF-5 和HNLF-44 菌株发酵液化感作用初探 23 2.3.6 HNLF-5 和HNLF-44 菌株鉴定结果 24 VI 2.4 讨论 27 2.4.1 内生真菌抑菌活性分析 27 2.4.2 内生真菌抗氧化活性分析 29 2.4.3 HNLF-5 和HNLF-44 发酵液对油种子化感作用初探的分析 29 2.5 本章小结 30 第3 章 HNLF-44 菌株全基因组测序分析 31 3.1 实验材料 31 3.1.1 实验菌株 31 3.1.2 仪器设备 31 3.1.3 试剂 31 3.2 方法 32 3.2.1 基因组DNA 的提取及检测 32 3.2.2 基因组测序及组装 32 3.2.3 基因组组分分析及基因注释 32 3.2.4 次级代谢产物合成基因簇预测 32 3.3 结果与分析 33 3.3.1 基因组测序数据质量评估 33 3.3.2 基因组拼接和基因预测 34 3.3.3 KEGG 注释 35 3.3.4 GO 功能分类结果 37 3.3.5 KOG 功能分类结果 42 3.3.6 碳水化合物活性酶注释 43 3.3.7 次级代谢产物合成基因簇预测结果 45 3.4 讨论 47 3.5