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第六章 生物信息的传递 ——从DNA到RNA;● 基本概念
● RNA聚合酶
● RNA转录的基本过程
● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较
● 内含子的剪切、编辑、再编码及化学修饰
;一、基本概念;参与转录的分子;RNA的种类:;● 基本概念
● RNA聚合酶
● RNA转录的基本过程
● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较
● 内含子的剪切、编辑、再编码及化学修饰
;RNA聚合酶是催化RNA合成的大分子:
RNA聚合酶
NTP+(NMP)n (NMP)n+1+PPi
;RNA聚合酶的反应条件; 2.2 原核生物中的RNA聚合酶
原核生物中由一种RNA聚合酶催化所有RNA (mRNA, rRNA和 tRNA)的合成。
核心酶: 2 ?,β;β’;ω亚基
RNA聚合酶全酶
σ亚基:启动子的识别
RNA聚合酶是目前已知的最大的酶之一。;;大肠杆菌RNA聚合酶的组成分析; 核心酶与DNA序列结合是随机的,平均结合常数是2×1011;
全酶因为包含σ亚基与特异序列(启动子)的结合能力提高,降低与随机序列结合的能力。
例如: T7噬菌体的全酶与随机序列平均结合常数是108-109,而与启动子结合常数是1012-1014 。平均提高了约106倍。;2.3 真核生物的RNA聚合酶;一、RNA聚合酶I的功能:细胞分裂间期,合成3种rRNA。
二、 RNA聚合酶Ⅱ的功能:合成各种mRNA和snRNA。
三、 RNA聚合酶Ⅲ的功能:合成前体 tRNA和 5S rRNA。;● 真核生物RNA聚合酶;eukaryotic RNA polymerases的活性; RNA聚合酶没有校对功能
可以吗?
可以解释什么现象?;● 基本概念
● RNA聚合酶
● RNA转录的基本过程
● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较
● 内含子的剪切、编辑、再编码及化学修饰
;3、转录的基本过程;3.1.1 DNA 是RNA合成的模板:
模板链(反义链,非编码链, non-Coding Strand ):将DNA链中根据碱基互补原则指导RNA合成的DNA链称为模板链。
非模板链 (正义链,编码链, Coding Strand):与转录出来RNA顺序一致,但U代替了T。
;模板链与非模板链;3.1.2转录的不对称性:;;?3.2.1 转录起点:与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,即RNA聚合酶开始转录的位点,记做+1 :
上游区 +1 下游区
Upstream Downstream
; 转录开始的部位记做+1,称为转录起始点,与复制起始点(ori)不同,ori为一个区域,转录起始点为一个碱基,与转录相同的方向为下游,标记为+1,+2,+3……,与转录相反的方向为上游,标记为-1,-2,-3…,注意没有0。
;3.2.2启动子
是一段位于结构基因5’端上游区的DNA序列,能够活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合,并具有转录起始的特异性。
是RNA聚合酶起始RNA合成时特异结合的DNA序列.;● 启动子的发现——印迹法;T85T83G81A61C69A52;原核生物典型启动子的结构; ;
;(二)真核生物启动子;真核生物启动子的结构;1)核心启动子;2)上游启动子元件;TATA 区主要负责转录的精确启始,如果去掉,转录产物数量不会下降很多,但是启始位点各不相同,很多不具备生物活性;
GC区与 CAAT区等主要控制转录频率,基本不参与启始位点的确定,CAAT区对转录频率的贡献最大,该区任一碱基的改变都将极大的影响该基因的转录强度; GC区与 CAAT区无位置效应,当全部位于TATA区上游时,二者之间的距离(碱基数)对启动子的影响很大。;真核生物的基因并不是都具备上述元件,例如:SV40的早期基因没有TATA区和CAAT 区,都是有6个串联的GC区;组蛋白H2B基因,不含GC区,但是有两个CAAT,一个TATA区;SV40 早期启动子
组蛋白H2B
;3)真核顺式调控元件:增强子;增强子的作用特点:;(三) 转录的起始及起始复合物形成; 3.1 原核生物RNA合成转录的起始
RNA合成在启动子上起始包括:封闭复合物,开放复合物和三元复合物的形成。
RNA聚合酶含盖在起始点的
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