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DB32/T 3762.4—2020
PAGE I
新型冠状病毒检测技术规范 第4部分:重组酶介导等温扩增程序
范围
本部分规定了新型冠状病毒实验室核酸重组酶介导等温扩增检测的环境与设施、设备与耗材、试剂与材料、样本前处理与核酸提取、扩增体系配制与扩增、结果判定。
本部分适用于新型冠状病毒实验室核酸重组酶介导等温扩增检测。
规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB 19489 实验室生物安全通用要求
医疗机构临床基因扩增管理办法 原中华人民共和国卫生部办公厅
医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则 原中华人民共和卫生部检验中心
新型冠状病毒实验室生物安全指南 中华人民共和国家卫生健康委员会
术语和定义
下列术语和定义适用于本文件
等温扩增 isothermal amplification
在等温条件下,短时间内进行核酸扩增的一种基因扩增方法。
重组酶介导等温核酸扩增技术 recombinase aided amplification, RAA
一种利用重组酶、单链结合蛋白、DNA聚合酶在等温条件下(最佳温度37℃)进行核酸扩增的技术。其原理为:重组酶、单链结合蛋白、引物形成复合体扫描双链DNA,在与引物同源的序列处使双链DNA解旋,单链结合蛋白(SSB)防止单链DNA复性,在能量和dNTP存在的情况下,由DNA聚合酶完成链的延伸,5min~15 min就可实现仪器扩增。
逆转录 reverse transcription, RT
由一条RNA单链转录为互补DNA,由依赖RNA的DNA聚合酶(逆转录酶)来完成,或称反转录。
环境与设施
同本标准 第3部分4.1和4.2。
设备与耗材
设备
生物安全柜、离心机、涡旋振荡器、水浴或金属浴、核酸提取仪、RAA恒温震荡离心仪、RAA恒温核酸扩增检测仪。
耗材
N95及以上防护口罩、医用无纺布帽、护目镜、连体防护服、一次性PE手套、一次性手术衣、乳胶手套、防水靴套、微量移液器及各种配套带滤芯Tip头、1.5 mL EP管、冻存管、冻存盒。
试剂与材料
试剂
核酸提取试剂盒、RT-RAA核酸扩增试剂盒。
材料
消毒剂:75%乙醇;有效氯5500mg/L的消毒液(需每天新鲜配制);生理盐水或磷酸盐缓冲液(PH=7.4);4%NaOH或含1g/L蛋白酶K的磷酸盐缓冲液或0.1%二硫苏糖醇的磷酸盐缓冲液。
样本前处理与核酸提取
同本标准 第3部分7.1和7.2。
扩增体系配制与扩增
RT-RAA核酸扩增试剂盒在室温融化后,瞬时离心,按n+1配置反应体系(n=样本数+1管阳性对照+1管阴性对照),每个反应体系配置如下:
重组酶介导等温扩增反应体系
组成
体积(μL)
灭菌水
12.7
缓冲液Ⅵ
25
上游引物(10 μM)
2.1
下游引物(10 μM)
2.1
探针(10 μM)
0.6
上述体系配置完成后用手指轻弹混匀,短暂离心。向反应单元中加入42.5 μL 上述混合液,盖紧管盖,用手指轻弹混匀,短暂离心。
打开反应单元管,管盖内侧加入2.5 μL乙酸镁。
向反应单元管中依次加入5 μL 阴性对照、模板核酸、阳性对照,盖紧管盖。
将反应管移至RAA恒温震荡离心仪中,长按震荡键,39 ℃预处理7 min。
上述程序结束后,把反应管立即移到RAA恒温核酸扩增检测仪中,点击运行键,39℃运行30 min。
结果判定
阳性判断
反应结束后,设置斜率为20,仪器将自动进行数据分析,自动呈现判定结果;
10 min内,扩增曲线的斜率≥20时判断为新型冠状病毒核酸阳性;否则判断为阴性。
结果分析
阳性质控品为阳性;阴性质控品为阴性。
如检测结果不符合9.2.1的要求,该实验视为无效,应检查仪器、试剂等的偏差,确认无误后重新检测。
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