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·180 ·第 39 卷第 6 期 Vol. 39 No. 6
·180 ·
2023 年 6 月 HUNAN JOURNAL OF TRADITIONAL CHINESE MEDICINE Jun. 2023
引用 :李继兴 ,李伊花 ,刘晓波 . 基于数据挖掘、网络药理学和分子对接研究中药治疗消化性溃疡的作用机制[ J] . 湖南中 医杂志 ,2023 ,39(6) :180- 189.
基于数据挖掘、网络药理学和分子对接 研究中药治疗消化性溃疡的作用机制
李继兴 ,李伊花 ,刘晓波
( 大理大学药学院 ,云南 大理 ,671000)
[ 摘要] 目的 :研究中药治疗消化性溃疡( PU) 的作用机制 。方法 :检索 2020 年版《 中华人民共和国 药典》与药智数据库中中药治疗 PU 的处方 , 利用 Spss Modeler 进行数据挖掘得到核心药物 。从 TCMSP 数据库中获取核心中药的主要活性成分及作用靶点 ,GeneCards、OMIM、DrugBank、DisGenet 数据库中获取 疾病靶点 ,取交集靶点 。对交集靶点进行可视化分析 , 筛选后得到核心靶点与核心成分 , 并进行基因本体 ( GO) 功能和京都基因与基因组百科全书( KEGG) 通路富集分析和分子对接 。结果 : 获得甘草、延胡索、 白芍、白及、党参 5 味核心药物 , 药物聚为 3 类 ,核心活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素、柱头 甾醇 ,核心靶点为环加氧酶( PTGS2) 、表皮细胞因子( EGF) 、表皮生长因子受体( EGFR) 、白细胞介素 - 6 ( IL- 6) 、胱天蛋白酶( CASP3) 等 16 个 。获得 603 条 GO 条目 ,主要涉及氧化应激反应、蛋白磷酸化、泛素 蛋白连接酶等 。KEGG 富集条目共 118 条通路 , 核心靶点主要富集在肿瘤坏死因子、白细胞介素 - 17 ( IL- 17) 等信号 通 路 。 结 论 : 5 味 中 药 治 疗 PU 可 能 是 通 过 调 控 PTGS2、EGF 等 靶 点 及 TNF、IL - 17、 MAPK、HIF- 1 等通路的表达来实现。
[ 关键词] 消化性溃疡 ; 中药 ;数据挖掘 ; 网络药理学 ;分子对接 ;作用机制
[ 中图分类号] R259. 731 [ 文献标识码] A DOI :10. 16808/j. cnki. issn1003-7705. 2023. 06. 037
Mechanism of action of traditional Chinese medicine in treatment of peptic ulcer:
A study based on data mining ,network pharmacology ,and molecular docking
LI Jixing ,LI Yihua ,LIU Xiaobo
( School of Pharmacy ,Dali University ,Dali 671000 ,Yunnan ,China )
[Abstract] Objective:To investigate the mechanism of action of traditional Chinese medicine ( TCM) in the treatment of peptic ulcer ( PU) . Methods:Pharmacopoeia of The People ’s Republic of China ( 2020 edition) and Yaozhi Database were searched to obtain the TCM prescriptions for PU ,and SPSS Modeler was used for data mining to obtain core drugs. TCMSP database was used to obtain the main active components of core TCM drugs and their action targets , and GeneCards , OMIM , DrugBank , and DisGenet databases were used to obtain disease targets ,with intersecting targets obtained
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