基因组学与后基因组时代研究热点演示文稿.pptVIP

图20-16 全基因组文库的构建和测序策略 中科院北京基因组研究所所长杨焕明博士任主席。 从美国得州大学休斯顿医学院回国，在基因组研究所担任SNP研究项目的首席科学家及科研部部长的曾长青博士被委以重任，负责国际“人类基因组单体型图”计划的“中国卷”的实施与协调。 中科院北京基因组研究所负责3号染色体的大部分及其8号染色体短臂，约占整个基因组长度的6％。 香港小组的港大平台负责3号染色体短臂的70MB的一段区域，约占整个基因组的2.5％。 国家人类基因组南方中心负责21号染色体的HapMap构建，占整个基因组的1.1％。 当前第30页\共有56页\编于星期三\2点 当前第31页\共有56页\编于星期三\2点 Nature：“And now for the proteome”（ 409:747,2001) Science：“Proteomics in genomeland” （ 291:1221,2001) 当前第32页\共有56页\编于星期三\2点 第二节蛋白质组学（Proteomics ） 当前第33页\共有56页\编于星期三\2点 蛋白质组（ proteome）： 根据Wilkins Mr等的定义，Proteome一词源于PROTEin与genOME的杂合，意指一种基因组所表达的全套蛋白质； Swinbanks则指出proteome代表一完整生物的全套蛋白质； Kahn P则认为proteome反映不同细胞的不同蛋白质组合。 由此可见，proteome的含义：一个基因组、一种生物或一种细胞/组织所表达的全套蛋白质。 当前第34页\共有56页\编于星期三\2点 What are Proteomics? ?Study of the Proteome“ ?protein complement of the genome in a cell, tissue or organism“ ? proteins can be alternatively spliced and/or post-translationally modified (PTMs) Genome Proteome Cell-specific expression stress drugs Metabolic state Culture conditions 当前第35页\共有56页\编于星期三\2点 当前第36页\共有56页\编于星期三\2点 蛋白质组研究的开端 Proteome一词由Mare Wilkins于1994年在意大利Siena的一次2-DE会议上首次提出。 1995年，悉尼大学Humphery Smith I实验室与Williams等4家实验室合作，对至今已知最小的自我复制生物Mycoplasma genitalium（一种支原体）进行了蛋白质成分的大规模分离与鉴定，并在文献中首次公开使用“proteome”一词。 当前第37页\共有56页\编于星期三\2点 The smallest genome: Mycoplasma genitaium ★1995年，分离和鉴定了一种最小的能自我复制的生物Mycoplasma genitaium (580kb, 468ORFs)的全部蛋白质，并首次提出蛋白质组(Proteome)的概念。 一个独立生存的细胞生命至少需要多少个基因和表达蛋白? 当前第38页\共有56页\编于星期三\2点 蛋白质组研究的重要历史事件 ★ 1994年，Marc Wilkins最早提出了蛋白质组(Proteomics)的概念。 ★ 1995年，悉尼大学Humphery Smith 实验室与Willams等四家实验室共同分离与鉴定Mycoplasma genitaium的蛋白质组，“Proteome”首次出现。(Electrophoresis, 1995, 16: 1090-4) ★ 2001年，国际人类蛋白质组组织(Human Proteome Organization, HUPO)宣告成立。 ★ 2002年，第一次国际人类蛋白质组大会召开。 “人类血浆蛋白质组计划(Human Plasma Proteome Project, HPPP)” 和人类肝脏蛋白质组计划(Human Liver Proteome Project, HLPP)首批执行计划启动。 当前第39页\共有56页\编于星期三\2点 Eleven HUPO-sponsored Scientific Initiatives: Human Liver Proteome Project (HLPP) ，中国牵头的人类肝脏蛋白质组计划。 Human Brain Proteome Project (HBPP