蛋白质组学专业知识讲座.pptx

蛋白质组学;;对蛋白质数量、构造、性质、互相关系和生物学功能进行全面深入研究已成为生命科学研究迫切需要和主要任务。 ;The era of ‘omics’-based science Genomics （基因组学） Post-genomic science （后基因组时代） Functional genomics （功能基因组学） Transcriptomics（ 转录组学） Proteomics （蛋白质组学） Metabolomics （代谢组学） Structural genomics （构造基因组学） Aim - 3D structures of all protein folds ! ; 第一节 蛋白质组学概念及发展进展 第二节 蛋白质组体现模式研究办法 第三节 蛋白质组功能模式研究办法 ; 第一节 蛋白质组学概念及发展进展 ; 蛋白质组（proteome）：PROTEins + genOME，意思是Proteins expressed by a genome（基因组体现所有蛋白质）。 1994年由Williams和Wilkins提出，是一种动态概念，指是不一样细胞在不一样步相体现不一样蛋白质。 ;对应于基因组所有蛋白质组成整体，不是局限于一种或几个蛋白质。 同一基因组在不一样细胞、不一样组织中体现情况各不相同 。 在空间和时间上动态变化着整体。;蛋白质组学(proteomics) ;主要研究内容 ; 体现蛋白组学 The study of global changes in protein expression;; 基因组 转录组 蛋白组;;功能蛋白质组学(functional proteomics)提出 ;从局部入手研究蛋白质组各个功能亚群体。 将多种亚群体组合起来，逐渐描绘出接近于生命细胞“所有蛋白质”蛋白质组图谱。;发展进展;美国国立癌症研究院（NCI）投资1 000万美元建立肺、直肠、乳腺、卵巢肿瘤蛋白质组数据库。 NCI和FDA共同投资数百万美元建立癌症不一样阶段蛋白质组数据库。 英国建立三个蛋白质组研究中心对已完成或即将完成全基因组测序生物体进行蛋白质组研究。 ; Celera公司投资上亿美元独自启动了全面判定和分类汇总人类组织、细胞和体液中蛋白质及其异构体，构建新一代蛋白质体现数据库工作。; 1997年召开了第一次国际“蛋白质组学”会议 1998年在美国旧金山召开了第二届国际蛋白质组学会议 1999年1月在英国伦敦举办了应用蛋白质组会议 ; 我国也于1998年启动了蛋白质组学研究，在中科院上海生物化学研究所举办了???次全国性蛋白质组学研讨会 ; 2003成立了中国人类蛋白质组组织（CHHUPO），并分别于2023年9月、2023年8月以及2023年8月召开了中国蛋白质组学首届、第二届及第三届学术大会，2023年10月在中国北京召开了第三届国际蛋白质组学会议。 ; 科技部已将疾病蛋白质组研究列入我国“973”计划项目和“863”计划项目；国家自然科学基金委员会也将“蛋白质组研究”列为重点项目。 我国在鼻咽癌、白血病、肝癌和肺癌蛋白质组研究方面取得了较大进展。;第二节 蛋白质组体现模式研究办法;研究蛋白质组组成成份、差异和功能;（一）蛋白质组研究中样品制备 ;样品预分级主要办法; 样品预分级主要作用在于提升低丰度蛋白质上样量和检测敏捷度。;组织水平上蛋白质组样品制备;激光捕捉显微切割(laser capture microdissection，LCM) ;（二）蛋白质组研究中样品分离;;;特 点;2-DE技术缺陷 ;新型非凝胶技术 ; （三）常见蛋白质显色技术 ;常见显色办法比较;考染和银染比较;;;有机染料和银染;负 染;胶体扩散染料;有机荧光团染料;金属螯合染料;（四）凝胶图像处理分析和胶内酶切;;;;;正常肝细胞和肝癌细胞蛋白质组双向电泳差异体现谱;蛋白质胶内酶切;;（五）质谱分析;原理;;Sir Joseph John Thomson - 1923年诺贝尔物理奖主要奉献：气态下离子导电理论和试验摸索??Frederick Soddy - 1923年诺贝尔化学奖主要奉献：使我们对放射活性物质结识大大提升，另外他对同位素起源和性质也作了出色工作。??Francis William Aston - 1923年诺贝尔化学奖主要奉献：使用质谱办法大规模研究非放射性元素同位素；提出整数规则。??Hans G. Dehmelt and Wolfgang Paul - 1989年同获