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ICS65.020.01B15
中华人民共和国农业行业标准
NY/T2678—2015
马铃薯6种病毒的检测RT-PCR法
Detectionofthesixpotatoviruses—RT-PCRmethod
2015-02-09发布2015-05-01实施
中华人民共和国农业部
发布
I
NY/T2678—2015
前言
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。
本标准由农业部种植业管理司提出并归口。
本标准起草单位:农业部脱毒马铃薯种薯质量监督检验测试中心(哈尔滨)、湖南农业大学园艺学
院、华中农业大学生命科学技术学院、福建农林大学。
本标准主要起草人:张威、白艳菊、李学湛、柳俊、詹家绥、聂碧华、胡新喜、何长征、高艳玲、范国权、申宇、张抒、王晓丹、王文重、魏琪、邱彩玲、耿宏伟、董学志、万书明。
1
NY/T2678—2015
马铃薯6种病毒的检测RT-PCR法
1范围
本标准规定了马铃薯S病毒(PotatovirusS,PVS)、马铃薯X病毒(PotatovirusX,PVX)、马铃薯
M病毒(PotatovirusM,PVM)、马铃薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)、马铃薯卷叶病毒(Potatoleaf-
rollvirus,PLRV)和马铃薯A病毒(PotatovirusA,PVA)的反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)分子生物学检测方法(见附录A)。
本标准适用于马铃薯试管苗、原原种和田间马铃薯块茎、植株等组织中病毒的检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的,凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
3原理
本标准采用反转录—聚合酶链式反应(reverse-transcriptionpolymerasechainreaction,RT-PCR)方法检测马铃薯病毒。其原理是,将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术,RNA在反转录酶的作用下反转录成cDNA,再以cDNA为模板,在TaqDNA聚合酶的作用下进行PCR扩增,根据PCR扩增结果判断该样品中是否含有目的片段,从而达到鉴定病毒的目的。
4试剂和材料
以下所有试剂,除非另有规定仅使用分析纯试剂,水为符合GB/T6682中规定的一级水。
4.1TRIzolRNA提取试剂
4.2三氯甲烷4.3异丙醇
4.475%乙醇
量取无水乙醇75mL,加水定容至100mL。
4.5M-MLV反转录酶(200U/L)
4.6RNA酶抑制剂(40U/L)
4.7TaqDNA聚合酶(5U/L)
4.810×PCRbuffer(Mg2+free)
4.9MgCl?(25mmol/L)
4.10dNTP混合物(各2.5mmol/L)
4.11焦碳酸二乙酯(DEPC)处理水
在100mL水中,加入焦碳酸二乙酯(DEPC)50μL,室温过夜,121℃高温灭菌20min,分装到
1.5mLDEPC处理过的离心管中。
4.1210×TAE电泳缓冲液
羟基甲基氨基甲烷(Tris)242g,冰乙酸57.1mL,乙二胺四乙酸二钠·2H?O37.2g,用氢氧化钠调pH至8.5,加水定容至1000mL。
2
NY/T2678—2015
4.131×TAE电泳缓冲液
量取10×TAE电泳缓冲液(4.12)100mL,加水定容至1000mL。
4.14溴化乙锭溶液(10mg/L)
称取溴化乙锭200mg,加水溶解,定容至20mL。
4.151.5%琼脂糖凝胶板
称取琼脂糖1.5g,加入1×TAE电泳缓冲液(4.13)定容至100mL,微波炉中加热至琼脂糖融化,待溶液冷却至50℃~60℃时,加溴化乙锭溶液(4.14)5μL,摇匀,倒入制胶板中均匀铺板,凝固后取下梳子,备用。
4.16引物缓冲液
用DEPC水将上、下游引物分别配制成浓度为100ng/pμL的水溶液。
4.17100bpDNA分子量标准物
4.18阳性对照
参见附录B中B.1。
4.19阴性对照
参见附录B中B.2。
5
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