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研究原著中国组织工程研究
ChineseJournalofTissueEngineeringResearchwww.CJTER.com
甲基化测序和转录组整合分析黄韧带肥厚的分子机制
何杨1,唐步源1,卢昌怀2
/10.12307/2025.291
文章快速阅读:甲基化测序和转录组整合分析黄韧带肥厚的关键基因及信号通路
投稿日期:2024-01-12
采用日期:2024-03-13
修回日期:2024-04-03甲基化测序差异甲基化位点PPI互作分析分析调控黄
在线日期:2024-04-16甲基化水平与韧带肥厚的
表达水平负相GO功能分析关键基因、
中图分类号:关的基因主要分子功
R459.9;R318;R274转录组整合差异表达基因KEGG通路能、主要作
分析用通路
文章编号:富集分析
2095-4344(2025)05-01013-08
文献标识码:A
文题释义:
DNA甲基化:是广泛存在于真核生物体内的生物学过程和表观遗传修饰,是储存表观遗传信息的最主要形式,也被认为是表观遗传的核
心,与许多生物学现象如衰老、疾病、肿瘤发生和死亡等有密切联系,通过检测正常和肥厚黄韧带组织中甲基化水平差异的位点,可以初
步判断调控黄韧带肥厚的潜在基因。
黄韧带肥厚:是在人体衰老过程中黄韧带出现的一种退行性改变,主要表现为黄韧带弹性纤维降解、胶原纤维大量增生、纤维结构改变,
最终发生纤维化和瘢痕形成,受老化、机械应力和活动水平等多项因素的影响,是引起腰椎管狭窄的决定性因素之一。
摘要
背景:黄韧带肥厚是腰椎管狭窄症的最主要病因,是多个病理因素共同作用的结果,目前黄韧带肥厚的分子机制、作用通路尚不明确,缺
乏有效的非手术治疗方案。
目的:使用甲基化测序和转录组整合分析方法,研究黄韧带肥厚发生发展的分子机制。
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方法:收集个正常黄韧带组织和个肥厚黄韧带组织,采用甲基化测序记录异常甲基化位点和甲基化状态,采用转录组整合分析记录异
常表达的基因,取二者交集中甲基化水平与表达水平负相关的基因。采用GO和KEGG富集分析研究差异基因表达的主要功能通路和分子功
能。使用PPI互作分析筛选调控黄韧带肥厚的关键基因。
结果与结论:对两组黄韧带行甲基化测序发现高甲基化位点37173个,低甲基化位点10583个,转录组整合分析发现异常表达基因720
个,其中463个上调基因、257个下调基因。两者重叠基因383个,其中192个基因甲基化水平与表达水平负相关。GO功能通路分析结果显
示分子功能富集到10个条目,细胞组分富集到15个条目,生物学途径富集到30个条目。KEGG通路富集分析结果显示,192个基因主要富
PI3K-AktRap1Focaladhesion
初级会计持证人
专注于经营管理类文案的拟写、润色等,本人已有10余年相关工作经验,具有扎实的文案功底,尤善于各种框架类PPT文案,并收集有数百万份各层级、各领域规范类文件。欢迎大家咨询!
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