分子模拟技术导论.ppt

计算机在化学化工中的应用;

分子模拟技术

molecularsimulationtechniques;本章要求;1.分子模拟技术导论;1.分子模拟技术导论;1.分子模拟技术导论;1.分子模拟技术导论;计算机化学又称为分子模拟技术，是根据理论化学的严密逻辑在计算机上研究化学问题的一系列技术。主要包括：

分子结构与几何尺寸研究

键长、键角、两面角、原子间距等

分子能量计算与过渡态搜索

趋于平衡时那种异构体最稳定，

利用反响态和过程态的能量计算反响速率

揭示反响历程

分子振动波谱分析

计算分子振动波谱，提示未知物质或分子

考察药物分子如何有效与生物酶活性位进行匹配

不同取代基的生物活性进行比较

与其它分子或组成分子间的化学作用研究

结构与性能的关系QSAR

QuantitativeStructureActivityRelationships(1960s);1.分子模拟技术导论;2.分子模拟技术的开展;各种与分子原子性质密切联系的近似模型;2.分子模拟技术的开展;2.分子模拟技术的开展;2.分子模拟技术的计算方法;2.分子模拟技术的计算方法;2.分子模拟技术的计算方法;2.分子模拟技术的计算方法;2.分子模拟技术的计算方法;intermolecular

interactions;2.分子模拟技术的计算方法;2.分子模拟技术的计算方法;2.分子模拟技术的计算方法;2.分子模拟技术的计算方法;2.分子模拟技术的计算方法;2.分子模拟技术的计算方法;MonteCarlo模拟

与分子动力学相似，但描述的是分子在随机温度下的变化行为，

是系统在温度变化上的平均

与真实分子的行为更接近

可预测物质热力性质;2.分子模拟技术的计算方法;;2.分子模拟技术的计算方法;Abinitio(HF/6-31G*)

分子力场;2.分子模拟技术的计算方法;3.分子模拟技术的实现;3.分子模拟技术的实现;3.分子模拟技术的实现;;内坐标系;3.分子模拟技术的实现;三维动态显示;分子显示模式;构建分子模型;构建分子模型;构建分子模型;构建分子模型;计算与分子模拟;能量最小化原那么与结构优化;能量最小化原那么与结构优化;构型搜索与优化;构型搜索与优化;计算与分子模拟;4.分子模拟技术的应用;化学反响机理研究;化学反响机理研究;化学反响机理研究;化学反响机理研究;在分子波谱计算与解析方面的应用;在材料机械性能分析方面的应用;NO在催化剂外表的吸附与分解;Relationshipsbetween

DNAoraminoacid

sequence 3Dstructureproteinfunctions

Useofthisknowledgeforpredictionoffunction,molecularmodelling,anddesign(e.g.,newtherapies);分子对接与药物设计;分子器件研究与设计;分子器件研究与设计;在高分子材料方面的应用;高分子发光材料设计;碳纳米管性能研究与预测;碳纳米管性能研究与预测;催化剂设计及性能研究;层状硅酸盐矿物插层模拟;;煤分子结构研究;煤分子结构研究;煤低温氧化与自燃机理分析