生物化学第六章 核酸.ppt

4、原核细胞mRNA的结构特点存在多顺反子，一条mRNA链上含多个基因信息，多顺反子之间含有非翻译区；在5’-起始密码子AUG之前，存在一段嘌呤核苷酸，与16srRNA的3’端的嘧啶核苷酸互补配对；原核细胞mRNA不是很稳定5、真核生物成熟mRNA的结构特点5’-末端有一个甲基化的鸟苷酸，称为”帽结构“（capsequence，m’GpppNm）；5‘端帽子结构抗核酸水解酶的水解，增强mRNA的稳定性，促进核糖体与mRNA的结合，加速翻译起始速度。3‘-末端有一段长达200个核苷酸左右的聚腺苷酸(polyA)，称为“尾结构”；3’末端多聚A的尾巴维持mRNA的稳定性，并与mRNA从核内向胞质的转位有关。在5’-起始密码子AUG较近的前导序列中一段嘧啶核苷酸，与18srRNA的3’端的嘌呤核苷酸互补配对。细胞内分子量最小的一类核酸，占RNA总量的15％，分子量25000左右，大约由70－90个核苷酸组成，沉降系数为4S左右。1、tRNA功能在细胞蛋白质合成过程中作为各种氨基酸的载体。tRNA载有激活的氨基酸，并运到核糖体，将氨基酸掺入到生长肽链中。2、tRNA特点（1）tRNA分子中含有10-20%的稀有碱基，包括双氢尿嘧啶（DHU）、假尿嘧啶（Ψ）和甲基化的嘌呤（mG，mA）。三、tRNA（transferRNA，tRNA）Ψ假尿嘧啶双氢尿嘧啶（2）tRNA中存在一些能局部互补配对的区域，能形成局部双链，进而形成一种茎-环状或发夹结构，由于茎环结构的存在，使tRNA形成了三叶草形的二级结构；（3）tRNA共同的三级结构：倒L型。3、tRNA的二级结构及其功能tRNA的二级结构可分为四臂四环：包括氨基酸接受臂、反密码（环）臂、二氢尿嘧啶（环）臂、T?C（环）臂和可变环。除了氨基酸接受区外，其余每个区均含有一个突环和一个臂。(1)氨基酸接受区：包含有tRNA的3’-末端和5’-末端，由7对碱基组成，3’-末端的最后3个核苷酸残基都是CCA（CpCpAOH），A为腺苷酸。氨基酸可与其成酯而活化，该区在蛋白质合成中起携带氨基酸的作用。

(2)反密码区：与氨基酸接受区相对，一般环中含有7个核苷酸残基，臂中含有5对碱基。其中环中正中的3个核苷酸残基称为反密码子，将由此与mRNA上的密码子配对，识别特异编码氨基酸。(2)各类双螺旋DNA的结构参数(3)双螺旋稳定的力氢键碱基堆积力（疏水相互作用及范德华力）类型旋转方向螺旋直径（nm）螺距（nm）每转碱基对数目碱基对与水平面倾角戊糖环翘起构象糖苷键构象A－DNA右2.552.31119oC-3’在内反式B－DNA右2.373.410.51oC-2’在内反式Z－DNA左1.843.8129o嘧啶C-2’在内，嘌呤C-3’在内嘧啶反式嘌呤顺式C-3’内式和C-2’内式是指呋喃核糖信封式构象中C3还是C2指向C5；糖苷键构象：嘌呤六元环或嘧啶的O指向；远离糖的为反式，指向糖的为顺式。三、DNA的三级结构DNA的三级结构指DNA双螺旋通过扭曲和折叠所形成的特定构象，包括不同二级结构单元间的相互作用、单链与二级结构单元间的相互作用以及DNA的拓扑特征。1、环形DNA大部分原核生物的DNA是共价封闭的环状双螺旋。包括某些病毒、噬菌体、细菌质粒、真核生物线粒体和叶绿体、细菌染色体DNA。线形DNA的两端有粘末端，也可借助DNA连接酶将互补的粘末端连接成环形DNA。2、超螺旋结构当DNA双螺旋分子以一定构象自由存在时，处于能量最低状态，为松弛型；如果额外多转或少转几圈，就会使双螺旋中存在张力。当双螺旋分子的末端是开放的，这种张力可以通过链的转动而释放出来，DNA将恢复正常的双螺旋状态；但如果DNA分子的两端是固定的，或者是环状分子，这种额外的张力就不能释放掉，DNA分子本身就会发生扭曲，用以抵消张力。这种扭曲称为超螺旋（双螺旋的螺旋）。两手分别捏住线性DNA分子两端，其中的一端或两端同时向相反的方向捻动。当向右捻动时（即沿右手螺旋方向捻动），等于紧旋（所谓的“上劲”）。处于这样状态的DNA分子相对于它的松弛状态是一种超过原有旋转状态的状态，所以称为过旋。将处于松弛状态（B构型）的双螺旋向左捻动时（即沿右手螺旋相反方向捻动），等于解旋（所谓的“卸劲”）。处于这样状态的DNA分子相对于它的松弛状态是一种没有达到原有旋转状态的状态，称为欠旋。当将线性过旋或欠旋的双螺旋DNA连接形成一个环时，都会自动形成额外的超螺旋来抵消过旋或欠旋造成的应力，目的是维