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基因组学与应用生物学2024年,第43卷,第4期,第569-578页
研究论文
ResearchArticle
马铃薯GRF基因家族的鉴定和表达模式分析
石蒙蒙王德颖谢浩杰秦志广刘紫婕韩宝佳呼雨君郭文慧孙永旺
聊城大学农学与农业工程学院,聊城,252100
*通信作者,sunyongwang@
摘要生长调节因子(growth-regulatingfactor,CRF)家族基因编码植物特有的转录因子,在植物生长发育和胁迫响应等许
多生物学过程中发挥重要调节作用。本研究利用生物信息学方法全面鉴定了马铃薯(Solanumtuberosum)GRF基因家族,并分
析了其表达模式。在马铃薯基因组中共发现了12个CRF家族基因(StGRF1~StCRF12),其编码的蛋白均含有QLQ结构域和
WRC结构域;StGRF基因分布在马铃薯的9条染色体上,染色体片段复制可能导致了该家族基因在马铃薯基因组中的扩张;
系统进化分析显示,StGRF可以分为5组,同组的基因成员具有相似的基因结构,且其编码的蛋白具有相似的保守结构域分
布;StGRF成员启动子区域存在丰富的激素和胁迫响应相关元件;表达模式分析显示,StGRF在马铃薯不同发育时期及各个
组织中呈现出多样化的表达特征,这说明不同成员可能在马铃薯生长发育过程中发挥特异的调控作用。以上结果可为进一
步探索StGRF的功能提供一定基础。
关键词马铃薯;生长调节因子;基因家族;生物信息学;表达模式
Genome-wideIdentificationandExpressionAnalysisoftheGRFGeneFamilyin
Potato
SHIMengmengWANGDeyingXIEHaojieQINZhiguangLIUZijieHANBaojiaHUYujunGUOWen-
SUNYongwang
hui
CollegeofAgronomyandAgriculturalEngineering,LiaochengUniversity,Liaocheng,252100
*Correspondinauthor,sul@
D0I:10.13417/j.gab.043.000569
AbstractGrowth-regulatingfactor(GRF)familygenesencodeplant-specifictranscriptionfactorsthatplaycriticalrolesinmanybiologi-
calprocessessuchasplantgrowthanddevelopment,andstressresponse.Inthisstudy,bioinformaticsapproacheswereemployedforthe
genome-wideidentificationandexpressionpatternanalysisoftheGRFgenefamilyinpotato(Solanumtuberosum).Atotalof12GRFfam-
ilygenes(StGRFI~StGRF12)wereidentifiedinthepotatogenome,andtheirencodedproteinsbothcontaintheQLQdomainsandWRC
domains.TheStGRFweredistributedon9chromosomesofpotato,andchromosomalsegmentalduplicationsmayhavecontributedtothe
expansionofthisgenefamily.PhylogeneticanalysisshowedthatStGRFcouldbedividedinto5groups,andmembersfromthesamegroup
exhibitedsimilargenestructuresandconservedmotifdistribution.Abundantelementsassociatedwithhormoneandstressresponsiveele-
mentswerefoundinthep
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