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基因组学与应用生物学2024年,第43卷,第4期,第569-578页

研究论文

ResearchArticle

马铃薯GRF基因家族的鉴定和表达模式分析

石蒙蒙王德颖谢浩杰秦志广刘紫婕韩宝佳呼雨君郭文慧孙永旺

聊城大学农学与农业工程学院,聊城,252100

*通信作者,sunyongwang@

摘要生长调节因子(growth-regulatingfactor,CRF)家族基因编码植物特有的转录因子,在植物生长发育和胁迫响应等许

多生物学过程中发挥重要调节作用。本研究利用生物信息学方法全面鉴定了马铃薯(Solanumtuberosum)GRF基因家族,并分

析了其表达模式。在马铃薯基因组中共发现了12个CRF家族基因(StGRF1~StCRF12),其编码的蛋白均含有QLQ结构域和

WRC结构域;StGRF基因分布在马铃薯的9条染色体上,染色体片段复制可能导致了该家族基因在马铃薯基因组中的扩张;

系统进化分析显示,StGRF可以分为5组,同组的基因成员具有相似的基因结构,且其编码的蛋白具有相似的保守结构域分

布;StGRF成员启动子区域存在丰富的激素和胁迫响应相关元件;表达模式分析显示,StGRF在马铃薯不同发育时期及各个

组织中呈现出多样化的表达特征,这说明不同成员可能在马铃薯生长发育过程中发挥特异的调控作用。以上结果可为进一

步探索StGRF的功能提供一定基础。

关键词马铃薯;生长调节因子;基因家族;生物信息学;表达模式

Genome-wideIdentificationandExpressionAnalysisoftheGRFGeneFamilyin

Potato

SHIMengmengWANGDeyingXIEHaojieQINZhiguangLIUZijieHANBaojiaHUYujunGUOWen-

SUNYongwang

hui

CollegeofAgronomyandAgriculturalEngineering,LiaochengUniversity,Liaocheng,252100

*Correspondinauthor,sul@

D0I:10.13417/j.gab.043.000569

AbstractGrowth-regulatingfactor(GRF)familygenesencodeplant-specifictranscriptionfactorsthatplaycriticalrolesinmanybiologi-

calprocessessuchasplantgrowthanddevelopment,andstressresponse.Inthisstudy,bioinformaticsapproacheswereemployedforthe

genome-wideidentificationandexpressionpatternanalysisoftheGRFgenefamilyinpotato(Solanumtuberosum).Atotalof12GRFfam-

ilygenes(StGRFI~StGRF12)wereidentifiedinthepotatogenome,andtheirencodedproteinsbothcontaintheQLQdomainsandWRC

domains.TheStGRFweredistributedon9chromosomesofpotato,andchromosomalsegmentalduplicationsmayhavecontributedtothe

expansionofthisgenefamily.PhylogeneticanalysisshowedthatStGRFcouldbedividedinto5groups,andmembersfromthesamegroup

exhibitedsimilargenestructuresandconservedmotifdistribution.Abundantelementsassociatedwithhormoneandstressresponsiveele-

mentswerefoundinthep

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