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2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学与草地生态学的关系
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分)
1.在草地生态学研究中,用于鉴定未知物种或评估物种多样性的DNA条形码标记,其序列数据通常首先通过哪个生物信息学数据库进行查询和比对?
A.GenBank
B.PDB
C.UniProt
D.EMBL
2.当需要比较来自草地中不同物种的多个基因序列,以探究物种间的进化关系时,以下哪种生物信息学工具或软件最为常用?
A.BLAST
B.ClustalW
C.SAMtools
D.GATK
3.在分析草地生态系统环境因子(如温度、降水)与物种组成(如物种丰富度、多度)关系时,除了传统统计方法外,生物信息学中常借助哪些技术进行数据降维并可视化展示?
A.基因测序与基因表达分析
B.系统发育树构建
C.主成分分析(PCA)或多维尺度分析(MDS)
D.序列比对
4.草地生态系统功能(如初级生产力、养分循环)与微生物群落结构密切相关。为了研究草地土壤或植物根际的微生物群落组成和功能潜力,以下哪种“组学”技术是核心手段?
A.表观基因组学
B.转录组学
C.宏基因组学
D.蛋白组学
5.对于大规模草地生态系统研究产生的多物种基因组数据,进行物种分界、构建大型系统发育树以揭示谱系关系,通常需要借助哪些类型的生物信息学软件?
A.基因查找工具(如Geneious)
B.基因编辑软件(如CRISPR相关工具)
C.基于模型或距离法的系统发育推断软件(如PhyML,RAxML,BEAST)
D.DNA合成软件
6.在比较不同草地类型或不同放牧管理措施下牧草(如禾本科与豆科植物)的基因组变异时,以下哪种生物信息学分析方法能够有效识别与适应性相关的关键基因或位点?
A.基因表达谱分析(RNA-Seq)
B.变异检测(如SNPcalling)
C.物种系统发育分析
D.群体结构分析
7.草地生态系统研究常涉及大量环境样本(土壤、植物、水样)的DNA/RNA提取。在生物信息学层面,如何处理这些原始测序数据以获得可用于分析的序列?
A.基因测序
B.序列比对
C.数据质控与过滤
D.系统发育树构建
8.当研究者希望探索草地中某个功能基因(如参与氮循环的基因)在不同物种间的存在差异、表达模式或进化历史时,以下哪种生物信息学数据库是重要的资源?
A.PubMed
B.NCBI(特别是RefSeq,GenBank分区)
C.WebofScience
D.Scopus
9.在利用生物信息学方法分析草地生态数据时,选择合适的统计模型或分析算法对于得出可靠结论至关重要。以下哪项是选择分析方法的必要前提?
A.数据量越大越好
B.选用最复杂的模型
C.充分理解数据的性质、研究目的以及所用方法的假设前提
D.必须使用公开源代码的工具
10.随着测序技术的发展,单细胞水平的草地生态系统研究成为可能。生物信息学在单细胞数据分析中面临的主要挑战之一是什么?
A.数据量相对较小
B.数据维度极高,噪声较大
C.单细胞测序成本极低
D.单细胞数据无法进行系统发育分析
二、填空题(每空2分,共20分)
1.生物信息学在草地生态学研究中,不仅可用于分析______的遗传多样性和进化关系,还可用于研究______群落结构、功能基因以及它们与______环境的相互作用。
2.对草地牧草或重要伴生植物进行基因组测序后,需要通过______等生物信息学手段进行基因识别和功能注释,以理解其适应草地环境的遗传基础。
3.利用高通量测序技术获取草地土壤微生物群落的总DNA(即______)数据,是进行群落结构分析、功能潜力评估以及探究微生物与植物互作的基础。
4.在比较不同草地类型或处理下的生态系统功能时,生物信息学方法可以帮助分析______(如功能基因丰度、代谢物特征)的变化,并揭示其与环境因子和物种组成的关系。
5.为了将生物信息学分析结果更好地应用于草地生态保护和管理实践,研究者需要具备将______结果与______背景知识相结合,进行综合解释的能力。
三、简答题(每题5分,共15分)
1.简述利用生物信息学方法进行草地中某个目标
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