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宏基因组二代测序技术在血液病患者感染病原诊断中的应用中国专家共识(2023年版)解读精准诊断助力血液病感染防控
目录第一章第二章第三章背景与意义技术原理与流程临床实施规范
目录第四章第五章第六章2023版共识更新要点临床案例分析应用价值与展望
背景与意义1.
血液病患者因原发病或治疗导致免疫功能严重受损,感染风险显著升高,且临床表现常不典型,易被原发病症状掩盖。免疫功能低下细菌、真菌、病毒及罕见病原体均可能感染,传统检测方法(如培养、PCR)覆盖范围有限,难以全面筛查。病原谱广泛培养需数日至数周,且阳性率低(如血培养仅30%-40%),延误精准治疗时机。传统检测时效性差患者常同时感染多种病原体,传统方法难以同步检测,导致漏诊或误诊。混合感染常见血液病患者感染诊断难点
mNGS技术核心优势无需预设靶标,可一次性检测DNA/RNA病原体(包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等),覆盖罕见或新发病原。广谱病原检测直接检测临床样本中的核酸,24-48小时内出具报告,尤其适用于急危重症感染诊断。高灵敏度与速度同步检测病原体耐药基因(如碳青霉烯酶基因),指导抗生素精准选择,优化治疗方案。耐药基因分析
明确mNGS在血液病发热待查、重症肺炎、中枢神经系统感染等场景的优先级别,避免滥用或漏检。规范应用场景技术标准化多学科协作成本效益平衡统一样本采集(如血浆、肺泡灌洗液)、测序流程及生信分析阈值,减少假阳/阴性结果。强调感染科、血液科与微生物实验室联合解读报告,结合临床判断,避免过度依赖技术结果。提出分层检测策略(如先常规检测后mNGS),在诊断价值与医疗经济负担间取得平衡。共识制定临床必要性
技术原理与流程2.
高通量测序技术基于二代测序平台对临床样本中所有核酸(DNA/RNA)进行无偏倚测序,可同时检测细菌、病毒、真菌、寄生虫等病原体,突破传统培养法的局限性。病原体核酸富集通过宿主核酸去除、靶向捕获或全基因组扩增技术提高病原体核酸比例,确保低载量病原的检出灵敏度。数据库比对分析将测序数据与病原微生物基因组数据库比对,通过特异性序列标记实现病原体种属鉴定和耐药基因检测。010203mNGS检测基本原理
输入标题运输保存条件样本类型选择优先选择感染部位标本(如血液、肺泡灌洗液、脑脊液),避免污染;对于血流感染需采集足量全血(≥3mL)以提高检出率。针对血液病患者免疫功能低下特点,需增加测序深度(≥20Mreads)以提高低丰度病原体检出率。要求样本核酸浓度≥0.1ng/μL,宿主DNA占比≤95%,并设置阴性对照排除环境或试剂污染。使用专用核酸稳定管,室温下运输不超过24小时,4℃保存不超过72小时,避免反复冻融导致核酸降解。特殊人群适配质量控制标准样本采集处理规范
要点三原始数据过滤去除低质量序列(Q值20)、短读长(50bp)及宿主来源序列(如人基因组hg38),保留高质量微生物数据。要点一要点二病原体鉴定通过Kraken2、Centrifuge等算法与NCBIRefSeq等数据库比对,设定阈值(如≥3条特异性读长)避免假阳性。耐药与毒力分析结合ARGs-OAP、VFDB等数据库预测耐药基因和毒力因子,为临床用药提供分子依据。要点三生物信息分析流程
临床实施规范3.
免疫功能低下患者血液病患者因原发病或治疗导致免疫功能受损,感染风险显著增高,mNGS技术可覆盖广谱病原体,尤其适用于传统检测阴性但临床高度怀疑感染的病例。疑难复杂感染对于临床表现不典型、病原体种类复杂(如混合感染)或常规微生物学检测耗时长的病例,mNGS可快速提供病原学依据,指导精准治疗。重症感染早期诊断血流感染、中枢神经系统感染等危重情况需快速明确病原体,mNGS的高通量特性可缩短诊断时间窗,改善预后。适用人群与适应症
全血样本适用于血流感染或播散性感染的检测,需注意样本采集时机(如发热期)及抗凝剂选择(EDTA优于肝素),以减少假阴性风险。肺部感染首选样本类型,可提高呼吸道病原体(如细菌、真菌、病毒)的检出率,尤其对免疫抑制患者的侵袭性真菌感染诊断价值显著。中枢神经系统感染的关键样本,需确保无菌采集并优先送检,mNGS可突破传统培养的限制,检测苛养菌、病毒及罕见病原体。深部组织感染(如脓肿、骨髓炎)的病原学诊断金标准,需结合病理检查,mNGS可辅助鉴定培养阴性或特殊病原体(如结核分枝杆菌)。肺泡灌洗液(BALF)脑脊液(CSF)组织活检标本送检样本类型选择
报告解读标准化需结合患者病史、症状、影像学及传统检测结果,区分病原体定植与感染,避免过度解读低序列数或环境背景菌。临床相关性评估建立实验室特异性阈值(如reads数、基因组覆盖度),排除污染或测序噪音,确保结果可靠性;同时标注检测限及技术局限性。阈值设定与质量控制由感染科、血液科、微生物实验室共同参与报告解读,制定个体化抗感
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