基于TCGA数据库筛选结肠癌Wnt信号通路关键基因及其预后分析.pdfVIP

医学检验与临床2025年第36卷第4期MedicalLaboratoryScienceandClinics,2025,Vol.36,No.4

doi:10.3969/j.issn.1673-5013.2025.04.001

基于TCGA数据库筛选结肠癌Wnt信号通路关键基因及

其预后分析←

甄秋来1马洪波1鲍杰²石海燕34

1（淄博市淄川区医院输血科，山东淄博255100)

2（淄博市淄川区医院检验科，山东淄博

255100)

255200)

3（淄博市第一医院输血科，山东淄博

[摘要目的：利用生物信息学技术筛选与结肠癌发展及预后密切相关的潜在关键基因。方法：访问癌症基因组图

谱（TCGA）并下载结肠癌患者的RNA表达数据和临床信息。利用R软件筛选结肠癌差异表达基因(DEGs）并对

其进行KEGG通路富集分析，筛选在Wnt信号通路中显著富集的差异表达基因(DEGs)。利用STRING数据库构

建蛋白质相互作用网络（(PPI）并筛选Wnt通路连接度排名前10位的基因。运用Kaplan-Meier方法对筛选出的基因

进行生存曲线评估，获取与结肠癌患者预后相关的关键基因。利用“gpubr”包对关键基因与临床病理特征的相关关

系进行分析并绘制箱线图。通过TIMER2.0网站（）、GEPIA数据库（http://gepia.

cancer-pkucn/）分析关键基因在不同肿瘤组织和正常组织中的表达情况，基因相关性以及免疫浸润分析。结果：共

鉴定出33个显著富集于Wnt信号通路的DEGs，其中连接度最高的前10个基因为WNT3A、AXIN2、DKK1、

LEF1、WNT3、WNT11、WNT7B、DKK4、WIF1和WNT2。生存分析表明，WNT11高表达组患者的生存期显

著低于低表达组(P0.05)，提示其预后不良。临床病理相关分析结果显示，WNT11表达与结肠癌患者的临床分期、

远处转移状态以及淋巴结转移状态具有显著差异（P0.05)。泛癌分析发现，WNT11在结肠癌、直肠腺癌、食管癌

肿瘤组织中表达高于正常组织（P0.05)，在乳腺癌、肾癌、肺癌、嗜铬细胞瘤、甲状腺癌肿瘤组织中表达低于正常

组织(P0.05)。基因相关性分析显示，WNT11与LEF1、AXIN2、WIF1、WNT2、WNT3表达呈正相关(P

0.05)。免疫浸润分析发现，结肠癌中WNT11的表达水平与CD4+T淋巴细胞以及癌症相关成纤维细胞浸润程度呈正

相关关系(P0.05)，与CD8+T淋巴细胞浸润程度呈显著负相关关系(P0.05)。结论：WNT11在结肠癌肿瘤中呈

高表达，其高表达与临床病理特征相关且预后较差，为探索结肠癌的发生发展机制及预后评估开辟了新的研究路径。

[关键词]Wnt信号通路；结肠癌；关键基因；泛癌分析；免疫浸润

ScreeningofkeygenesofWntsignalingpathwayincoloncancerbasedonTCGAdatabase

anditsprognosticanalysis

ZHENQiu-lai,MAHong-bo,BAOJie,etal

(Departmentofbloodtransfusion,ZichuanDistrictHospital,ShandongZibo255100)

[AbstractlObjective:Potentialkeygenescloselyassociatedwithcoloncancerprogressionandprognosisarescreenedusing

bioinformaticstechniques.Methods:Transcripto