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:1376:生殖医学杂志2025年10月第34卷第10期
DO1:10.3969/j.issn.1004-3845.2025.10.011·生物信息学研究·
人类不同年龄阶段睾丸细胞关键标志物的表达
基于单细胞RNA测序数据的分析
麻庆玲,华夏,李嘉丽,肖逸阳,韩冠华*,刘潇楠*
(广州医科大学附属妇女儿童医疗中心,广州510000)
【摘要】目的基于生物信息学技术分析文献中睾丸单细胞RNA测序数据,探讨睾丸主要细胞类型随年龄变化的特征
及其在不同发育阶段中的关键分子标志物。方法收集GeneExpressionOmnibus数据库已发表文章中不同年龄段男性睾
丸组织单细胞RNA测序数据,使用Seurat工具包进行数据分析。使用多篇相关文献中睾丸不同细胞类型的标志物,对各样
本中的细胞类型进行注释。结果筛选出了多种睾丸细胞类型的关键分子标志物,如支持细胞标志基因(SOX9、PRND、
BEX1、BEX2、BEX5、CITED1)、间质细胞标志基因(DCN、IGF1、INHBA、LHX9、LUM)、精原干细胞标志基因(POU5F1、
NANOG、SOX2)、精原细胞标志基因(DND1、DMRT1、FGFR3、GFRA1、ID4、KIT、NANOS3、NR6A1、PIWIL4、SOHLH2、
SSX3、UTF1)、精母细胞标志基因(CCNA1、DAZL、DMRTB1、MAGEA4、PIWIL1、PRDM9、PTTG1、SPATA16、SPO11、
SYCP1、SYCP2、SYCP3、GPR85)、精子细胞标志基因(PRM1、PRM2、PRM3、RNF151、SPACA3、TNP1、TSSK6、
TXNDC2)。进一步分析结果显示,生殖细胞标志基因的表达在新生儿期、青春期前、青春期后具有复杂的变化模式。另外,
研究发现支持细胞在发育早期分为两个明显的亚群,其中一群高表达SOX9、PRIND基因,该群细胞在发育过程中逐渐消
失。结论本研究基于人类睾丸单细胞转录组测序的文献数据,筛选出了生殖细胞的多个特异性标志基因,有助于准确鉴
定不同发育阶段的细胞类型并理解人类生殖系统的发育过程。
【关键词】单细胞RNA测序;睾丸发育;睾丸细胞类型;细胞标志基因
【中图分类号】R699;Q336【文献标识码】A
Explorationofkeymarkerexpressionofdifferentcelltypesinhumantesticulartissueatdifferentage:based
onsingle-cellRNAsequencingdataanalysis
MAQing-ling,HUAXia,LIJia-li,XIAOYi-yang,HANGuan-hua*,LIUXiao-nan*
GuangzhouWomenChildrensMedicalCenter,GuangzhouMedicalUniversity,Guangzhou510o00
[Abstract]
Objectives:Toinvestigateage-relatedcharacteristicsofmajortesticularcelltypesandidentifykey
molecularmarkersacrossdevelopmentalstagesbyanalyzingpublishedsingle-cellRNAsequencing
(scRNA-seq)dataofhumantestesusingbioinformaticsapproaches.
Methods:ThescRNA-seqdatasetsfromhumantesticulartissuesacrossdifferentagegroupswere
retrievedfromtheGeneExpressionOmnibusdatabase.DataanalysiswasperformedusingtheSeurat
toolkit.Celltypesineachsamplewereannotatedbasedonmarkergenesfrom
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