丁香罗勒(Ocimum gratissimum)叶片响应镉胁迫的比较转录组学分析.pdfVIP

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生物技术通报

·研究报告·BIOTECHNOLOGYBULLETIN2025,41(3):255-270

丁香罗勒(Ocimumgratissimum)叶片响应镉胁迫的比较

转录组学分析

王斌王玉昆肖艳辉

(韶关学院生物与农业学院广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室粤北特色果蔬工程技术研究中心,韶关512005)

摘要:【目的】丁香罗勒(Ocimumgratissimum)同时具有修复和安全利用镉(cadmium,Cd)污染土壤的潜力,解析丁香

罗勒响应Cd胁迫的分子机制,鉴定与Cd耐受性密切相关的调控因子,为耐受Cd胁迫的丁香罗勒种质资源创新提供候选基因资源。

【方法】采用比较转录组学的方法,分析Cd处理(35μmol/L)72h期间丁香罗勒叶片的转录组学变化。【结果】Cd胁迫显著抑制丁

香罗勒生长,叶片、茎和根中均积累了很高含量的Cd,根中的Cd含量最高。Cd胁迫还显著影响精油组分和含量,Cd处理诱导肉

桂酸甲酯的合成积累。转录组分析结果显示,在24h的比较组中,差异表达基因(differentiallyexpressedgenes,DEGs)富集在核糖

体、植物-病原相互作用和MAPK信号通路等途径中。在72h的比较组中,DEGs富集在光合作用、光合作用-天线蛋白和卟啉与叶

绿素代谢途径中。浅青色1模块内的基因与Cd胁迫表型显著相关,模块内的基因主要富集在植物激素信号转导、植物-病原相互作

用和MAPK信号通路途径中。Cd胁迫上调表达的DEGs也显著富集在这3个途径,表明激活这3个途径是丁香罗勒叶片应答Cd胁迫

的主要机制。Cd胁迫处理诱导13个转录因子基因表达上调,其中5个是bHLH家族基因,表明bHLH转录因子在丁香罗勒Cd胁迫

耐受性调控中具有重要作用。【结论】丁香罗勒应答Cd胁迫的分子机制与其他植物有很大相似之处,bHLH转录因子可能是调控丁

香罗勒Cd耐受性的关键转录因子。

关键词:丁香罗勒;镉胁迫;RNA-Seq;光合作用;bHLH转录因子

DOI:10.13560/ki.biotech.bull.1985.2024-0618

ComparativeTranscriptomicAnalysisofCloveBasil(Ocimum

gratissimum)LeavesinResponsetoCadmiumStress

WANGBinWANGYu-kunXIAOYan-hui

(CollegeofBiologyandAgriculture,ShaoguanUniversity,GuangdongProvincialKeyLaboratoryofUtilizationandConservationofFoodand

MedicinalResourcesinNorthernRegion,GuangdongProvincialEngineeringandTechnologyResearchCenterofSpecialFruitandVegetablesin

NorthernRegion,Shaoguan512005)

Abstract:【Objective】Clovebasil(Ocimumgratissimum)hasthepotentialforbothremediationandsafeutilizationofcadmium(Cd)-

contaminatedsoil.Elucidatingthemolecularmechanismso

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