蛇足石杉SAUR50基因家族的分子生物信息学及组织特异性表达分析.pdfVIP

2024年37卷12期西南农业学报

Vol.37No.12SouthwestChinaJournalofAgriculturalSciences2629

引用格式：

洗金燕，黄玉妹，陈秋洁，张鹏，王虹岚，刘，王柳萍,涂冬萍.蛇足石杉SAUR50基因家族的分子生物信息学及组织特异性表达分析[J].西南

农业学报,2024,37（12）：2629-2639.

XianJY,HuangYM,ChenQJ,ZhangP,WangHL,LiuS,WangLP,TuDP.Molecularbioinformaticsandtissue-specificexpressionanalysisof

SAUR50genefamilyinHuperziaserrata[J].SouthwestChinaJournalofAgriculturalSciences,2024,37(12):2629-2639.DOI:10.16213/j.cnki.sc-

jas.2024.12.008.

蛇足石杉SAUR50基因家族的

分子生物信息学及组织特异性表达分析

月桑,王柳萍,涂冬萍

洗金燕，黄玉妹，陈秋洁，张鹏,王虹岚,刘

（广西中医药大学药学院，南宁530200）

摘要：【目的】对蛇足石杉SAUR50基因家族的分子生物信息学及组织特异性表达进行分析，为提高蛇足石杉产量提供参考依

据。【方法】基于蛇足石杉全长转录组数据，利用生物信息学的方法对蛇足石杉SAUR50基因家族成员进行鉴定，分析其蛋白的理

化性质、亚细胞定位、结构域和保守基序，对蛇足石杉SAUR50基因家族成员组织表达特性进行分析。【结果】共鉴定出11个

SAUR50基因家族成员（HsSAUR50-1～HsSAUR50-11），

量为7290.48~16258.16kD，多为碱性蛋白，不具有跨膜结构，且均为稳定亲水性蛋白。蛇足石杉SAUR50蛋白二级结构均由α

螺旋、β折叠、延伸链和无规则卷曲4种结构共同组成，有蛋白结合、转移酶链和DNA蛋白结合3种三级结构，亚细胞定位在叶绿

体、细胞核中。系统发育进化分析将蛇足石杉SAUR50蛋白家族成员分为两大类（I和Ⅱ类），其中I类可分为2个亚类。蛋白结

构域分析结果显示，SAUR50家族蛋白共有2种结构域，分别为Auxininducible和Auxininduciblesuperfamily，具有促进基因在生长

素水平表达的功能。分析蛇足石杉SAUR50家族蛋白序列共获得3种保守基序，其中motif1在遗传进化中趋于稳定。蛇足石杉

SAUR50基因家族成员有与生长发育、激素响应、抗逆等相关的17种顺式作用元件。HsSAUR50-8等6个基因在茎中高表达，Hs-

SAUR50-2和HsSAUR50-6基因表达量排序均为茎叶芽胞孢子。【结论】共鉴定出11个蛇足石杉SAUR50基因家族成员，具

有高度保守基序和功能结构域，其组织表达具有特异性。蛇足石杉SAUR50基因家族大部分成员可能主要参与蛇足石杉茎和叶

的发育调控，能促进蛇足石杉植株增高及茎叶生长发育。

关键词：蛇足石杉；SAUR50基因家族；生物信息学；表达分析

中图分类号：S567.23文献标志码：A文章编号：1001-4829(2024)12-2629-11

Molecularbioinformaticsandtissue-specificexpressionanalysis

ofSAUR50genefamilyinHuperziaserrata

XIANJin-yan,HUANGYu-mei,CHENQiu-jie,ZHANGP