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2025年第61卷第01期科学技术
ScienceandTechnology·
基于重测序数据的猪繁殖性状全基因组关联分析
1,22,3333111,2114*
吕玲燕，林昌华，张胜斌，覃秀珍，柏秀芳，吴永绍，陈钊，刘磊，孙如玉，张冰，张家庆
（1.广西农业职业技术大学畜牧研究院，广西南宁530007；2.广西大学动物科学技术学院，广西南宁530004；
3.广西农垦永新畜牧集团西江有限公司，广西贵港537100；4.河南省农业科学院畜牧研究所，河南郑州450002）
摘要：为从全基因组水平上探究影响母猪繁殖性状的分子机理，本试验对连续3胎不同产仔数的母猪进行
全基因组重测序及关联分析，挖掘参与调控母猪高低产仔数性状的关键调控基因。本试验选取高繁母猪21
头，低繁母猪19头，采用illuminanovaseq6000PE150平台对40个文库进行全基因组重测序，结合母猪
连续3胎产仔数的表型性状，基于GLM混合线性模型，并利用质控后的14708672个SNP标记进行全基
因组关联分析。结果表明：总产仔数性状有87个SNP达基因组水平显著，候选基因包括RORA、SFRP1、
HSD17B1、IGF1；产活仔数性状有73个SNP达基因组水平显著，候选基因包括DAZL、STAT3；健仔数
性状有66个SNP呈基因组水平显著，候选基因包括DAZL、HSD17B1、STAT3；根据基因功能注释推测
IGF1、DAZL、HSD17B1、SFRP1、STAT3是繁殖性状的重要候选基因。本研究为猪繁殖性状的基因组选择
提供了重要的理论基础。
关键词：重测序；猪；繁殖性状；全基因组关联分析
中图分类号S828.2文献标识码ADOI编号10.19556/j.0258-703305
：：：
繁殖性状是影响种猪生产力的重要性状其性能因组测序并在此基础上对个体或群体进行全基因组水
，，
高低直接影响养猪场的经济效益[1]总产仔数产活仔平差异性分析可以全面挖掘基因序列差异和结构变异
。、，。
数及健仔数是衡量母猪繁殖性能的重要指标母猪产仔随着测序技术的快速发展以二代测序技术为主的高通
。，
数性状遗传力在0.1左右属于低遗传力性状[2]，而总量全基因组重测序技术推动了单核苷酸多态性Single
，（
产仔数与健仔数之间的遗传相关较高[3]。众多学者研究NucleotidePolymorphism，SNP）的挖掘与注释[11-12]。
结果表明利用传统育种方法提高母猪产仔性能的进程全基因组重测序技术将基因组测序数据与参考基因组进
，
较缓慢[4-6]随着测序技术的进步全基因组关联分析行比对分析获得包括SNP等大量遗传变异信息为
。，，，
Genome-wideAssociationStudyGWAS在动植物发掘畜禽种质特性筛选影响畜禽生产性能的关键通路
（，）
人力资源管理师持证人
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