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沈阳农业大学学报,2025,56(5):14-25http://
JournalofShenyangAgriculturalUniversityDOI:10.3969/j.issn.1000-1700.2025.05.002
赵贺,冀亚亮,梁潇,等.水稻LEA基因家族的全基因组鉴定及综合分析[J].沈阳农业大学学报,2025,56(5):14-25.
ZHAOH,JIYL,LIANGX,etal.Genome-wideidentificationandcomprehensiveanalysisofLEAfamilyinrice[J].JournalofShenyangAgri‐
culturalUniversity,2025,56(5):14-25.
水稻LEA基因家族的全基因组鉴定及综合分析
12344*5*
赵贺,冀亚亮,梁潇,阮班普,于彦春,马殿荣
(1.沈阳农业大学水稻研究所,沈阳110161;2.北京康普森生物技术有限公司,北京100000;3.辽东学院农学院,辽宁丹东
118003;4.杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州310000;5.辽宁省农业科学院,沈阳110161)
摘要:[目的]大量研究表明,LEA蛋白能够通过多种机制帮助植物应对环境压力,在水稻中仍有大量LEA家族成员的功能尚未
得到充分验证。因此,通过对水稻LEA基因家族(OsLEA)的生物信息学分析,并结合其在不同胁迫下的基因表达变化,旨在挖掘
参与水稻中响应非生物胁迫的OsLEA新成员。[方法]采用全基因组生物信息学方法对OsLEA基因家族进行了鉴定和分析。[结
果]水稻基因组中共包含83个OsLEA基因家族成员,这些基因不均匀地分布在12条染色体上,根据其结构域特征可分为8个亚家
族。理化性质分析显示,LEA蛋白具有广泛的亲水性和较强的稳定性。亚细胞定位预测表明,大多数LEA蛋白分布在细胞质、细
胞膜和线粒体等细胞组分中。启动子顺式作用元件分析表明,OsLEA基因的启动子区域富含与非生物胁迫、植物激素响应和生长
发育相关的元件。组织表达模式和激素响应分析揭示,OsLEA基因在不同组织和不同植物激素处理中表现出显著的表达特异性。
此外,非生物胁迫(低温、高温、盐和重金属镉)处理下,部分OsLEA基因表现出明显的应答。[结论]通过整合生物信息学分析及多
种激素与逆境胁迫下的表达谱数据,初步揭示了OsLEA基因家族参与逆境响应的分子调控机制。基于此,成功筛选出
Os04g0589800、Os05g0362600、Os06g0324400和Os08g0163600等核心成员基因,其在高盐、高温及低温胁迫下均呈现显著表达上
调特征,证实了它们在非生物胁迫应答中的关键生物学功能,为抗逆水稻育种提供了极具应用潜力的分子靶标。
关键词:水稻;LEA基因家族;非生物胁迫;启动子顺式作用元件;组织表达模式
中图分类号:S511文献标识码:A文章编号:1000-1700(2025)05-0014-12
Genome-wideIdentificationandComprehensiveAnalysisofLEAGene
FamilyinRice
12344*5*
ZHAOHe,JIYaliang,LIANGXiao,RUANBanpu,YUYanchun,MADianrong
(1.RiceResearchInstitute,ShenyangAgriculturalUniversity,Shenyang110161,China;2.BeijingCompsenBiotechnologyCo.,LTD.,Beijing100000,China;
初级会计持证人
专注于经营管理类文案的拟写、润色等,本人已有10余年相关工作经验,具有扎实的文案功底,尤善于各种框架类PPT文案,并收集有数百万份各层级、各领域规范类文件。欢迎大家咨询!
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