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☆2025年第20期LivestockandPoultryBreedingIndustry畜禽种业

猪遗传育种中表观基因组学运用分析

文│何丹（安徽省芜湖市三山经济技术开发区农村发展局）

在猪遗传育种领域，增效育种、化，二是组蛋白修饰，三是染色质可及示，差异甲基化位点超过1万个，差

抗病育种始终是主要的研究课题，以表性，四是基因组空间结构。异甲基化基因约2700个，其中有关肌

观基因组学数据为依据，能对猪抗性候二、猪遗传育种中表观基因组肉发育与肉质性状的基因共有15个，

选基因与经济性状候选基因进行鉴定，学的应用这使猪种研究数据得到进一步丰富；

以此为优质猪种培育提供支持。1.DNA甲基化。DNA甲基化指还有专家学者针对长白猪妊娠前、妊

一、表观基因组学概述的是将甲基添加到碱基上的过程，在娠中、妊娠后的整个阶段进行骨骼肌

遗传学改变与表观遗传学改变的此过程中，DNA甲基转移酶发挥着重全基因组甲基化图谱、骨骼肌生长发

最终结果均是改变基因表达水平，但要作用。在DNA甲基化的过程中，5-育图谱的构建，结果表明DNA甲基化

两者的作用机理不同，前者是改变基甲基胞嘧啶扮演着重要角色，其主要能对猪骨骼肌的发育起到决定性作

因序列，后者是改变非基因序列。其存在于真核生物基因组中，且数量较用，这一结果可进一步丰富动物肌肉

中，基因序列会通过基因突变、基因多。DNA甲基化能产生多样化功能，发育研究内容。

杂合等形式出现改变；非基因序列会主要有三，一是调控基因表达，二是2.组蛋白修饰。组蛋白修饰指

通过DNA甲基化、组蛋白修饰等形式保持染色质结构，三是基因印记。的是共价修饰，主要发生在组蛋白翻

出现改变。表观基因组学的研究以基在猪遗传育种中，需要应用DNA译后，其具有多种作用，包括改变染色

因组水平为基础，其内容以表观遗传甲基化，其主要决定着猪的生长发育质结构、改变染色质活性、对基因表达

学为重。在表观遗传学、表观基因组过程，影响着猪的健康状况。通常情予以调控以及转变DNA与其他核蛋白的

学研究中，DNA甲基化是重要内容，况下，品种不同的猪，其生长特点不相互作用等。通过分析组蛋白修饰谱可

其原因是人类发育与DNA甲基化的关同，运用全基因组差异分析方法，对发现，启动子、增强子分别与H3K4me3

系尤为密切。所谓DNA甲基化，指的DNA甲基化修饰进行分析，可以发现修饰、H3K4me1修饰密切相关。

是甲基基团与胞嘧啶共价结合的过不同品种的猪，其甲基化基因存在差组蛋白修饰能控制猪的生长发

程，其中，甲基基团来自S-腺苷甲异，以此为依据，能选出优质基因，育。在全基因组调控元件的鉴定上，

硫氨酸提供，胞嘧啶来自CpG二核苷保证遗传性状优良。有专家学者对不需要全面分析特定染色质组蛋白修饰

酸，且共价结合在DNA甲基化转移酶同品种猪的全基因组差异DNA甲基化与基因转录状态关系，通过注释可明

的作用下产生。CpG二核苷酸的存在做出研究，鉴定出重要的候选基因，确两点内容，一是猪复杂性状进化的

形式有两种，一是在基因组序列中分此候选基因与两项因素有关，一是猪基因组变异，二是猪适应性进化的基

散存在；二是以CpG岛的形式存在，肌肉发育，二是肉质性状，通过站在因组变异，为猪遗传育种工作提供支

CpG岛中含有大量CpG二核苷酸，其表现遗传视角对两个品种猪在肉品质持。有专家学者运用自转录调控区域

大小约为300～3000bp。由于CpG岛上的不同进行探究，能为生猪产业发测序技术对猪PK15细胞与睾丸ST细

一般靠近启动子，并在基因表达调控展提供参考；有专家学者对不同品种胞系进行检测，从中鉴定出与组蛋白

中参与，所以得到专家学者的高度关猪的精子DNA甲基化做出研究，结果修饰H3K9me3高度相关的功能增强

注，尤其是CpG岛异常高甲基化、异表明精子DNA甲基化直接影响着猪的子约2500个，并实现功能增强子图谱

常低甲基化能分别导致抑癌基因转录繁殖性状，这说明在牲畜基因组改良的构建，说明在猪遗传育种中功能增

失活、原癌基因激活，因