基于eDNA技术的大渡河上游玛柯河至脚木足河段鱼类多样性研究.pdfVIP

摘要

环境DNA（eDNA）技术指通过采集环境样本（水、土壤、空气等）从中提

取DNA，随后进行扩增、测序和分类分析，进而确定取样环境中生物分布状况的

方法。因具有灵敏度高、经济高效、环境友好等优点，已成为重要的生态监测新

方法，在长江实施“十年禁渔”期间，eDNA技术的优势更加突出。本文首次利用

eDNA宏条形码技术对大渡河上游玛柯河至脚木足河段的鱼类多样性进行了研究，

并将其与同期传统捕捞调查结果进行了比较。不仅为大渡河流域的鱼类多样性监

测在长江实施“十年禁渔”期间探索了新的方法，还为评估水生生物现状及群落

提供了基础数据，为保护和恢复重点保护水生动物提供科学依据。本研究主要结

果如下：

1、在设计鱼类通用引物时发现12SrRNA基因引物存在部分近缘鱼类无法识

别的问题。本研究基于裂腹鱼属27种鱼类Cytb基因序列，设计出1对针对裂腹

鱼属鱼类eDNA监测通用引物“LFYCytb58/LFYCytb292”。并成功鉴定出实验室

小型水族箱中6种裂腹鱼属鱼类和野外样点的5种裂腹鱼属鱼类。

2、本次基于eDNA技术的大渡河上游玛柯河至脚木足河段鱼类多样性的监测，

共在9个监测点鉴定到31种鱼类，隶属于5目11科25属。其中主要为鲤形目

（Cypriniformes）鱼类23种，占74.19%，优势种为软刺裸裂尻鱼（Schizopygopsis

malacanthus）、细尾高原鳅（Triplophysastenura）、东方高原鳅（T.orientalis）、草

鱼（Ctenopharyngodonidellus）、齐口裂腹鱼（Schizothoraxprenanti），多为喜流水

类鱼类。还监测到国家I级保护动物川陕哲罗鲑（Huchobleekeri）以及国家II级

保护动物重口裂腹鱼（Schizothoraxdavidi）在大渡河上游调查河段的分布，为其

保护提供一定的科学依据。另监测到长江上游特有物种6种以及外来鱼类7种。

3、与同时期流刺网加地笼调查的3目4科9属15种鱼进行比较。两种方法共

检出鱼类35种，均以鲤形目（Cypriniformes）为主，其中有11种鱼类是在两种调

查方法中均检测到的，占鱼类总数的31.4%，eDNA技术与流刺网加地笼法单独监

测到的鱼类分别占总数的57.2%、11.4%。eDNA技术检出的鱼类物种数和多样性

指数略高于传统捕捞方法。与传统捕捞调查方法相比eDNA技术在水生鱼类信息

方面具有更高的敏感性，可以有效监测识别水体中难捕捞和数量较少的鱼类，从

而弥补了传统捕捞调查法在鱼类资源调查上的局限性。故两种调查方式的结合,可

以扩大研究范围、提高精确性和效率，更加快速且准确的揭示大渡河上游鱼类多

样性、群落特征以及动态变化。

综上，eDNA技术对大渡河上游鱼类多样性监测是有效的，也是可行的。不仅

可作为江河湖海鱼类多样性监测的有力工具，还为长江流域的鱼类多样性在“十

年禁渔”期间的监测和保护以及渔业资源管理提供一定的基础。

关键词：eDNA技术；大渡河上游；鱼类多样性；鱼类通用引物

Abstract

EnvironmentalDNAmacrobarcodingtechnologyreferstothemethodofextracting

DNAfromenvironmentalsamples(suchaswater,soil,air,etc.),andthenperforming

amplification,sequencing,andclassificationanalysistodeterminethedistributionof

organismsinthesampledenvironment.Duetoitsadvantagesofhighsensitivity,

economicefficiencyandenviron