《现代农业生物技术》课件——实验结果分析.pptxVIP

CAREERPLANNING基因等位变异实验数据结果分析

前sAPX-1基因差异分析PsAPX-1a基因序列分析及蛋白序列结构、功能预测PsAPX-1a基因及编码蛋白系列进化分析05CONTENTS目录

01前言基因等位变异

实验背景介绍前期我们提取槜李叶片的总DNA，通过琼脂糖凝胶电泳检测(图A)，确保DNA质量的可靠性，以保证后续基因克隆实验的进行。利用设计的引物，以槜李DNA为模板进行PCR扩增，PCR扩增结果大小约为2000bp（图B）。后将PCR产物进行纯化、克隆，检测到阳性克隆。并对阳性克隆进行测序，最终获得DNA序列信息。实验目标与预期根据前期实验所获得的DNA序列信息，本次实验课将对其进行包括基因序列分析，蛋白序列结构、功能预测，基因及编码蛋白系列分析在内的系统化研究。以取得所需实验数据材料，为后续实验的进行提供理论数据支持。实验背景与目标

02PsAPX-1基因差异分析基因等位变异

将前期所获得的5条槜李PsAPX-1序列，分别命名为PsAPX-1a、PsAPX-1b、PsAPX-1c、PsAPX-1d和PsAPX-1e，再运用EditSeq将目标序列翻译为氨基酸（图1）。目标基因检索图1

而后在NCBI上进行BLASTX检索（图2，图3），将先前准备好的氨基酸序列复制到目标框之中（图4）。