生物信息学知识在医学编辑工作中的应用.pdfVIP

生物信息学知识在医学编辑工作中的应用 １） ２） ３） 收稿日期：２００９０２１７ 陈婕 　魏新智 　赵雨杰 　 修回日期：２００９０６２２ １）中国实用医学杂志社，１１０００１　沈阳市和平区南京南街９号５层，Ｅｍａｉｌ：ｃｈｅｎｊｉｅｓｕｎｙｔ＠１６３．ｃｏｍ ２）辽宁中医药大学附属医院中医药实验中心，１１００３２　沈阳市皇姑区北陵大街３３号，Ｅｍａｉｌ：ｗｘｚ＿１９８４＠ｙａｈｏｏ．ｃｏｍ．ｃｎ ３）中国医科大学生物芯片中心及生物信息学教研室，１１０００１　沈阳市和平区北二马路９２号，Ｅｍａｉｌ：ｙｊｚｈａｏ＠ｍａｉｌ．ｃｍｕ．ｅｄｕ．ｃｎ 摘　要　　生物信息学是一门新兴的综合性学科，医学编辑在实际工作中经常会遇到与生物信息学相关数据库的应用问题。 医学编辑应该重视生物信息学的学习和应用，为审稿提供强有力的支持，从而提高审稿质量。 关键词　　生物信息学　医学编辑　数据库 　　中国科技期刊编辑学会编写的《科技期刊编辑教程》中 １．１　对期刊编辑校验有价值的各种现有序列数据库 对科技期刊编辑人员素质提出要求：“编辑人员对所编辑期 （１）医学研究者在科研论文中通常会检测患病者的基 刊涉及的学科要有较全面的知识，科技编辑的素质和知识结 因、蛋白或者核酸等序列，之后与相关数据库中现有的序列 构应是综合型的，在知识方面要博，在编辑业务要专”。随着 进行比对查询，因此医学期刊编辑对各种数据库应有所了 生物学与信息科学迅速的发展，二者融合而成的生物信息学 解。比如，常用的核酸类数据库有美国生物技术信息中心 也以迅雷不及掩耳的速度发展起来，其综合运用了生物学、 （ＮａｔｉｏｎａｌＣｅｎｔｅｒｆｏｒＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＮＣＢＩ）的核苷酸序列数据 数学、物理学、信息科学及计算机科学等学科。医学编辑在 库（ＧｅｎＢａｎｋ）、欧洲的核苷酸序列数据库（ＥＭＢＬ）、日本的 实际工作中常常会遇到有关应用生物信息学分析医学科研 ＤＮＡ数据库（ＤＤＢＪ）等；与蛋白质相关的数据库有蛋白质数 论文结果，描述医学疾病诊断、治疗，揭示“基因组信息结构 据库（ＳＷＩＳＳ－ＰＲＯＴ）、蛋白质信息资源库（ＰＩＲ）、蛋白质结 的复杂性及遗传信息的根本规律”，阐释生命遗传规律等情 构修饰数据库（ＲＥＳＩＤ）、Ｅｎｔｒｅｚ的蛋白质三维结构数据库 况。因此，医学编辑应重视生物信息学的学习和应用，利用 （ＭＭＤＢ）、蛋白质交互作用数据库（ＤＩＰ）、蛋白质家族指纹数 各种信息检索资源，提供方便快捷的稿件质量评定媒介，为 据库（ＰＲＩＮＴＳ）等；与疾病相关的数据库包括综合临床数据 审稿提供强有力的支持。本文就生物信息学在医学编辑工 库，如 ＮＣＢＩ疾病基因数据库、基因卡片（ＧｅｎｅＣａｒｄｓ）等；与 作中的应用加以探讨。 遗传性疾病相关的数据库，如遗传性疾病数据库（ＧＤＢ）、人 １　生物信息学知识在医学期刊稿件评价中 类遗传性疾病数据库（ＧｅｎｅＤｉｓ）等；与肿瘤相关的数据库， 的应用 如肿瘤网（Ｃａｎｃｅｒ．ｇｏｖ）、肿瘤基因组解剖工程（ＣＧＡＰ）等；与 　　医学编辑在处理医学科研论文时，应首先评价其水平， 心血管疾病相关的数据库，如心血管疾病相关生物医学数据 校验其科学性、创新性、实用性及科研设计方法的合理性，决