水稻光叶性状基因gl1的精细定位与候选基因分析.pdfVIP

核 农 学 报 2011，25(6)：1088—1093 1088 JournalofNuclearAgriculturalSciences 文章编号 ：tO00—8551(2011)06—1088—06 水稻光叶性状基因gll的精细定位与候选基因分析 洪 隽 王启钊 富昊伟 吴殿星 舒庆尧 (1．浙江大学原子核农业科学研究所／农 业部浙江省核农学重点实验室 ，浙江 杭hi 310029 2．浙江嘉兴市农业科学院，浙江 嘉兴 314016) 摘 要：光叶水稻是一类在叶片和谷粒等表面都光滑无毛的水稻 ，是美国南部和非洲一些 国家的主栽品 种 。已有研究表明水稻的光叶性状受一对位于第 5染色体上的隐性基 因gll控制。本试验 旨在对 gll 进行精细定位 ，分析候选基 因，为最终克隆gll基因、研究毛状体形态建成的调控奠定基础。首先根据 与 1连锁的RFLP标记在第5染色体上的大致位置，有选择地用第 5染色体上的部分微卫星(SSR)标 记研究热带光叶粳稻 (AP9)与毛叶籼稻 (浙恢 7954)的杂交分 离群体 中与光叶性状的共分 离，获得 了与 gll连锁 的 SSR标记 RM17990。在此基础上 ，采用与 RM17990相邻的更多 SSR标记 以及插入 ／缺失 (InDe1)标记将 gll定位在 RM17759一RM17831之间(物理 区间为538kb～1．649Mb)。为进一步缩小范 围，发展 了毛细管电泳方法和能够识别单碱基多态性 (SNP)的四引物扩增受阻突变体 系一PCR(Tetra— primeramplificationrefractorymutationsystem PCR，ASPCR)标记 ，将 gll的区间缩至 770．5～977．1kb之 间。结合其他 实验室有关gll定位的最新结果 ，本研究将 gll定位在971～977．1kb之 间，并对其 中的全 部4个注释基因进行测序分析，发现只有LOC—Os05g02750的5’端非翻译 区在光叶水稻和毛叶水稻之 间存在一个碱基差异 ，该差异可能是造成光叶突变的原 因。 关键词：水稻；光叶；gll；毛状体 ；精细定位 FINE MAPPING AND CANDIDATE GENE ANALYSiSOFGLABROUSLEAF ANDHULLGENE (gl1)INRICE (OryzasativaL．) HONGJun WANGQi．zhao FUHao．wei WUDian．xing SHUQing．yao (1．KeyLaboratoryofNuclearAgriculturalSciencesofZhejiangProvinceandMinistryofAgriculture，Institute ofNuclearAgriculturalSciences，ZhefiangUniversity，Hangzhou，Zhejiang 310029； 2．JiaxingAcademyofAgriculturalSciences，Jiaxing，Zhejiang 314016) Abstract：Glabrousriceisakindofricethatishairlessonthesurfaceofitsleavesandgrains．Itisthemain grown cuhivarinthesouthernregionoftheUnitedStatesandinmanyAfricancountries．Ithasbeenprovedthattheglabrous traitiscontrolledbytherecessivegenegllonchromosome5．Thiss