水稻缺素胁迫下实时荧光定量RT-PCR 的内参基因的选择.pdfVIP

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2018-03-23 发布于北京
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水稻缺素胁迫下实时荧光定量RT-PCR 的内参基因的选择.pdf

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Online system: http:// 农业生物技术学报 Journal of Agricultural Biotechnology 2013, 2111: 1302~1312 DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2013.11.006 研究报告 Letter 水稻缺素胁迫下实时荧光定量 RT-PCR的内参基因的选择 1, 2 2 2 1, 2 1, 2* 1, 2* 魏毅东陈玉郭海萍谢华安张建福王宗华 1福建农林大学生命科学学院,福州 350002; 2农业部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/福州国家水稻改良分中心/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室/福建省作物种质创新与分子育种省部共建国家重点实验室培育基地/杂交水稻国家重点实验室华南基地/水稻国家工程实验室/福建省农业科学院水稻研究所,福州 350003 *通讯作者, jianfzhang@163.com; zonghuaw@163.com 摘要营养元素的吸收和利用是影响水稻产量的重要决定因素。利用qRT-PCR进行缺素胁迫下水稻功能基因的表达分析时,应当筛选适合于缺素胁迫下 qRT-PCR分析的内参基因。本研究以缺乏氮、磷、钾、钙、镁、硫6种大量元素 1周和2周的水稻Oryza sativa L. ssp. japonica幼苗组成的缺素样品池为材料, 选取12个水稻管家基因作为缺素条件下 qRT-PCR的候选内参基因,利用 geNorm软件分析缺素条件下各基因总体表达的稳定性并筛选出适合于缺素处理下qRT-PCR分析的内参基因eIF4a,确定用于缺素条件下内参校正的最佳基因数量组合为2个。根据比较分析多种内参基因组合在不同缺素处理下的实际校正结果,证明内参基因的最佳组合对于缺素条件下 qRT-PCR分析的重要性以及校正结果的有效性。最后,验证了 eIF4a单基因校正的可行性与有效性,为 geNorm软件提供了有益的改进和补充,这为水稻缺素胁迫下qRT-PCR分析的提供了参考和借鉴。关键词荧光定量 RT-PCR,内参基因,水稻,缺素, geNorm Selection of Reference Genes for Real- time Quantitative RT- PCR in RiceOryza sativa L. ssp. japonica under Nutrient Deficiency 1,2 2 2 1,2 1,2* 1,2* WEI Yi-Dong CHEN Yu GUO Hai-Ping XIE Hua-An ZHANG Jian-Fu WANG Zong-Hua 1 College of Life Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China; 2 Key Laboratory of Germplasm Innovation and Molecular Breeding of Hybrid Rice for South China, Ministry of Agriculture/Fuzhou Branch, National Rice Improvement Center of China/Fuji- an Engineering Laboratory of Crop Molecular Breeding/ Fujian Key Laboratory of Rice Molecular Breeding/Incubator of National Key Labora- tory of Fujian Germplasm Innovation and Molecular Breeding between Fujian and Ministry of Sciences Technology/South China Bases of Na- tional Key Laboratory of Hybrid Rice for China/National Rice Engineering Laboratory of China/Rice Research Institute, Fujian Academy of Ag- ricultural Sciences, Fuzhou 350003, China * Corresponding authors, jianfzhang@163.com; zonghuaw@163.com Abstract Mineral nutrient assimilation and utilization play a critic