7个地方鸡品种间遗传分化和聚类分析.pdfVIP

维普资讯 第 23卷 第 2期 云南农业大学学报 Vo1．23 No．2 2008年 3月 JournalofYunnanAgriculturalUniversity Mar．2008 7个地方鸡品种 间遗传分化和聚类分析 张学余 ，陈国宏 ，韩 威 ，朱云芬 ，陆进红 (1．中国农业科学院家禽研究所，江苏 扬州 225003；2．扬州大学动物科学与技术学院，江苏 扬州 225009) 摘要：利用29个微卫星标记，通过计算亚群体杂合度 (Hs)、总群体杂合度 (Ht)、遗传分化系数 (Gst)和 基因流 (Nm)，并基于Reynolds遗传距离 、Nei遗传距离运用 NJ和UPGMA聚类法构建4类聚类图，比较分 析国家地方禽种遗传资源基因库保存的7个地方鸡品种 (仙居鸡 、鹿苑鸡、固始鸡、大骨鸡、河南斗鸡、狼 山鸡和萧山鸡)间的遗传分化和亲缘关系。结果表明，7个地方鸡种 29个微卫星标记的总群体杂合度和亚群 体杂合度的平均值分别为0．642和0．551，平均遗传分化系数为 0．142；7个地方鸡品种间，萧山鸡与鹿苑鸡 的基因流动最大 ，为5．8327；狼山鸡与固始鸡的基 冈流动最小，为 0．8053；基于Reyonalds遗传距离运用 NJ 聚类法获得的7个鸡种间的聚类图较为准确地反映了7个地方鸡种间的遗传分化和亲缘关系。 关键词：微卫星；地方鸡种；遗传分化；聚类分析 中图分类号 ：S831．2 文献标识码 ：A 文章编号：1004—390X (2008)02—0225—05 GeneticDifferentiation andClusteringAnalysis 0f7ChineseIndigenousChickenBreeds ZHANG Xue—yu ，CHEN Guo—hong ，HANWei，ZHU Yun—fen ，LUJin—hong (1．PoultryInstitute，ChineseAcademyofAgriculturalScience，Yangzhou225003，China； 2．CollegeofAnimalScienceandTechnology，YangzhouUniversity，Yangzhou225009，China) Abstract：Theaveragegenediversity(Hs)withinpopulation，thetotalgenediversity(Ht)，thecoef_ ficientofgeneticdifferentiation(Gst)，andgeneflow (Nm)of7chickenbreeds，includingXianju chicken (XJ)，Luyuanchicken (LY)，Gushichicken (GS)，Daguchicken (DG)，HenanGame chicken (HG)，Langshanchicken (LS)andXiaoshanchicken (XS)conservedinStateGeneBank ofChina Poultry Breeding，were measured by using 29 microsatellite markers． On the basis of Reynolds’geneticdistancesandNei’Sgeneticdistances，4 dendrogramsofclusteringwereconstructed forthe7chickenbreedsbyusingneighborjoining(NJ)methodand(UPGMA)method．Theresults showedthattheaverageHs，HtandGstwere0