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物理化学学报(WuliHuaxueXuebao)
November ActaPhys.一Chim.Sin.,2010,26(11):3067—3072 3067
[Article】 www.whxb.pku.edu.cn
甲醇和氨对腺嘌呤水解脱氨机理的影响
刘海英 , 孟凡翠 李 萍 丁世 良。
(济南大学理学院,济南 250022; 天津药物研究院,天津 300193;。山东大学物理学院,济南 250100)
摘要: 用密度泛甬理论在B3LYP/6—311G(,p)水平上研究了甲醇和氨辅助的腺嘌呤水解脱氨机理,结果表明该
反应首先是在水的亲核进攻下形成一个四面体结构中间体,然后该中间体通过构象变化得到两个不同构象,从
而找到两条不同反应路径.在路径 a中,辅助分子参与了过渡态的形成,起到转移氢原子的作用;而在路径b中,
辅助分子仅作为介质,没有参与过渡态的形成.在氨辅助的情况下,腺嘌呤在亲核反应前发生了胺一亚胺异构化,
而在甲醇辅助机理中则未发生该异构化.能量结果表明甲醇辅助腺嘌呤脱氨反应具有与水辅助类似的势垒,而
氨辅助反应的势垒则比水辅助的高.
关键词: 腺嘌呤脱氨;B3LYP;G3MP2;氨辅助; 甲醇辅助
中图分类号: 0641
EffectsofCH3OH andNH3ontheHydrolyticDeam ination
M echanism ofAdenine
LIU Hai—Ying’ MENG Fan—Cui LIPing DING Shi—Liang。
(SchoolofScience,UniversityofJinan,Jinan 250022,P.R.China; TianjinInstituteofPharmaceuticalResearch,
Tianjin 300193,P.R.China;。SchoolofP sics,ShandongUniversity,Jinan 250100,P.R.China)
Abstract: TheeffectsofCH30H andNH3onthehydrolyticdeaminationmechanism ofadeninewerestudiedby
densityfunctionaltheoryattheB3LYP/6—31lG(d,p)1eve1.Theresultsrevealthatate~ahedralintermediateisformed
afteranucleophilicauackbyawatermolecule.Twointermediatesoreformedthroughconformationa1changesand
differentpathwaysareresponsible.Inpathwaya.anassistantmoleculetakespartinhtefcIrmationofthetransitionstate
andactsasabridget0bansferahydrogenatom.whileinpathwaybtheassistantmoleculeisnotinvolvedinthe
creationofthertansitionstateandactsonlyasamedium .Theadeninetkaesplaceanamine—iminetautomerization
beforehtenucleophilicattackunderNH .which isnotthecaseforhtemethan
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