千岛湖细鳞鲴种群线粒体COI基因变异及遗传分化研究.pdfVIP

千岛湖细鳞鲴种群线粒体COI基因变异及遗传分化研究.pdf

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湖南农业科学 2011,(15):150~153 千岛湖细鳞鲴种群线粒体 COI基因变异及遗传分化研究 曲宪成,张 勇,刘其根,张开岳,蒋骄云,冯 龙 (上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306) 摘 要:首先利用鱼类线粒体COI基因两端的保守序列设计简并引物,扩增测序获得了细鳞鲴c0I基因1551bp序列全长。 然后利用COI基因部分序列标记对千岛湖汾口(FK)、姜家镇 (JJZ)、富文 (Fw)以及临岐(LQ)4个细鳞鲴群体84个样本的遗传多 样性和遗传结构进行了分析,结果表明:在4个群体中共检测到4种不同单倍型。四群体的单倍型多样性(h)分别为0.5000,0、 O.1425和0.1287,核苷酸多样性(耵)分别为0.0019,0、0.0002和0.0002,其中FK群体的单倍型多样性 (h)和核苷酸多样性(订) 水平最高,另外3个群体单倍型多样性(h)和核苷酸多样性(竹)水平都较低。AMOVA分析显示,群体间遗传变异 占总变异的 23.56%,群体内的遗传变异占总变异的76.44%,表明群体内变异是总变异的主要来源。研究结果表明千岛湖4个群体间没有明 显的遗传分化。 关键词:细鳞鲴;线粒体COI基因;遗传结构 中图分类号:$965.124 文献标识码:A 文章编号:1006-060X(2011)15—0150-04 GeneMutationandGeneticDifferentiationofM it0chOndrialCoI inXenocyprismicrolepisinQiandaohuLake QUXian-cheng,ZHANG Yong,LIUQi-gen,ZHANG Kai-yue,JIANGJiao-yun,FENG Long (CollegeofFisheriesandLifeSciences,ShanghaiOcena University,Shanghai201306,PR Abstract:Atfirst。usingtheconservedsequenceinbothterminalofmitochondrialCO I geneinfishestodesign degenerateprimers,thenthe1551bpofmitochondrialCOIgenesequenceofXenocyprismicrolepsi wasobtainedby amplificationandsequencing,andthenthegeneticdiversityand geneticstructureof84samplesfrom fourXenocypris microlepsipopulations (Fenkou,Jiangjiazhen,Fuwen,Linqi)inQiandaohuLakewereanalyzedbyusingpartial mitochondrial COIgenesequencemarkefi The resultsshowed thatfourdifferenthaplotypeswere detected from four populations,theirshaplotypediversities (11)were0.5000,0,0.1425and0.1287respectively,nucleotidediversities ) were0.0019,0,0.0002and0.0002respectively;amongfourpopulationsofXenocyprismicrolepis,Fenkoupopulation hadthehighesthand1T.andtheothersallhadlow hand盯.TheresultsofAMOVA analysisindicatedthatthegenetic mutationbetweenpopulationsaceountfor23.56% oftotalmutation.ndthegeneticmutationwithinpopulation account f0r76.44% oftotalmutatio

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