拟南芥DNA_J结构域蛋白的生物信息学分析及其亚细胞定位验证.pdfVIP

维普资讯 福建农林大学学报 (自然科学版) 第 36卷 第 4期 JournalofFujianAgricultureandForestryUniversity(NaturalScienceEdition) 2007年 7月 拟南芥DNA—J结构域蛋 白的生物信息学 分析及其亚细胞定位验证 宁正元 ，王爱荣 ，林文伟 ，林德书 ，张冬梅 ，刘 泓 ，周 洁 ，王宗华 (1．福建农林大学计算机与信息学院；2．福建农林大学功能基因组学研究中心，福建 福州 350002) 摘要：对拟南芥RSS1蛋 白进行了一系列生物信息学分析 ，结果表明：该蛋 白是一C端含有 DNAj结构域的辅助蛋 白，其N 端含有受体蛋白复合物AP-2结合区DPF／W和FxDxF区，中间区域含有可信度较低的丝氨酸富集区和谷氨酸富集区．该蛋 白可能具有ATP结合活性、丝氨酸／苏氨酸激酶活性和磷酸酶活性 ，可调控细胞循环和蛋白的磷酸化和去磷酸化作用．利用 洋葱表皮瞬时表达系统验证了RSS1一GFP融合蛋 白定位于细胞核中，为进一步研究该蛋 白的分子和生物学功能奠定了良好 基础． · 关键词：拟南芥；辅助蛋白；J结构域；生物信息学 中图分类号：Q7；Q23 文献标识码：A 文章编号：1671-5470(2007)04-0427-08 Bioinformaticsandsubcellularlocalizationanalysisofaprotein containing theDNA JdomainofArabidopsisthaliana NING Zheng·yuan ，WANG Ai·rong’，LIN Wen·wei，LIN De·shu ，ZHANG Dong—ITlel。， LIU Hong 。ZHOU Jie ，WANGZong．hua (1．CoHegeofComputernadInformation；2．FunctionalGenomicsCenter，FujianAgricultureandForestry University，Fuzhou，Fuiian350002，China) Abstract：A seriesofbioinfomr aticsnaalysisofRSS1proteinofArabidopsisthalianawasanalyzed．TheresultshowedthatRSS1had aJ-domain，resemblingclathrin—uncoatingfactorauxilinatitsCtemrinus．ItalsocontainedanAsp—Pro—Phe(DPF)adaptorprotein— bindingmotifnadFxDxFmotifattheN terminus，whichwasknowntObindtOtheappendagedomainofdorBsubunitsofanadap— torproteincomplexAP-2．Moreover，therewereaserine—richregionna daglutamicacid—richregion inRSS1．Thebioinfomr atics datasuggestedthatRSS1mighthaveATP—bindingactivity．serine／thrinekinaseorphosphataseactivitynaditmightregulatecellcy— cleorphosphorylationordephosphorylationofproteins．SubcelhflarlocalizationbyinstantexpressionofRSS1一GFPfusionproteinon onionepide