中国地方猪种分子进化研究.pdf

11斟农业大学博L学位沦文 中文摘要 本论文采用PCR结合荧光半自动检测技术(基因组扫描技术，GENESCAN技术)对 38个中国地方猪种、3个外来猪种和2个野猪样品的34个微卫星标记座位进行大规模基因 组扫描研究，为全面了解我国独具特色的猪品种起源和进化提供分子生物学理论依据，以 利于更好地利用我国优良的品种资源。 l 34个微卫星标记实验数据分析发现，标记多态信息含量在O．489～0．725之间；只有 t SW830微卫星座位PIC为0．489，其余微卫星座位的PIC均大于O 500。通过遗传距离计算 及种系发生树的构建表明中国家猪起源与北方野猪有关；分化时间计算发现青海八眉和互 助猪之间分化时间最短，遗传差异最小；中国地方猪种和外来猪种问分化时间最长，遗传 差异鼹大。大部分猪种分类结果与以前《中国猪品种志》分类结果相近，差异仅存在于华 中型和江海型猪科，中。 根据本论文的结果并结合前人的研究结果，将中国地方猪种归为以下类群： 第一类：藏猪(甘孜、贡布江达、迪庆)、八眉、互助猪、内江猪、荣昌猪、成华猪、 黔北黑猪、湘酲猪、清平猪 第二类 中梅山、小梅山、二花脸、姜曲海 第三类 通城、嵊县花、玉山、嘉兴黑、皖南花猪、莆田 第四类 槐猪、大花白猪、蓝塘、南宁猪、陆川I猪、五指山猪、临高猪、贵州香猪、 隆林猪、海南野猪、滇南小耳猪 第五类 赣东黑、乐平花猪、上高猪、圩猪 第六类 东北野猪、胶州黑猪、沂蒙猪、民猪 J 多态性分析，发现不同猪种中具有RsaI遗传多态：并得到以下结论： 1、所有群体中优势基因种类较少，仅B、c基因为主要优势基因：G基因在有些品种中也 为优势基因，但分布不如B，c基因广泛：在所有猪群中未检测到等位基因D。(此基因 座位遗传分化系数Gst为0．2189。Hat DQl3 dy～Weinberg平衡检验发现所有猪种SLA Jl囚外艟了2均处于4i。F衡状态。，一 ／ 仔件多念。mn，筇10、第94和第124位的3个碱基多态同时存在的组合占66％；笫10、 —————————』堕些塑塑型幽壅 94位碱基多态同时存在的组合仪占0．96％。1 3、 忙方独步性检验结果表明：大多数猪种问SLA—DQB基因外显子2出现的基因频率差异 极显著。 4、综合微卫星标记数据分析也表明中国地方猪种的起源与北方野猪有关。 关键词：中国地方猪种t微卫星标记，基因组扫描，MHC，PCR．RFLP 2 尘鬯查些查兰堕主堂堡堕兰 一———— ABSTRACT and2 loci0f38chineselocal breeds microsatellite breeds，3 Inthe pig foreignpig study．34 detection withthefluorescentsemi—automated ofwild were technology． types pig investigated and