番茄SlDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析.pdfVIP

植物研究 2014，34(1)：68～74 BulletinofBotanicalResearch 番茄 SIDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析 杜利欣 胡宗利 张建苓 陈国平 (重庆大学生物工程学院，重庆 400044) 摘 要 D尸基因属于DP／E2F转录因子家族，其编码的蛋白是E2F蛋 白的二聚化分子伴侣，可能参与调控细胞周 期、DNA复制、生长、分化、凋亡等多种细胞进程。根据SGN数据库登录的番茄序列 ，通过RT—PCR方法从野生型番 茄中克隆了一个DP基因，命名为S1DP1。生物信息学预测，S1DP1蛋白定位于细胞核，具有保守的DNA结合域、二 聚化区域和C一末端及多个磷酸化位点。蛋白质二级结构预测S1DP1蛋白含51．50％的环状结构，34．55％的仅螺旋 和2．66％的B折叠。荧光定量PCR分析外源激素对野生型番茄SIDP1基因表达量的影响，发现该基因受外源性 乙烯前体 ACC的诱导。对环境因子应答的RT—PCR结果表明，在伤害和盐处理的叶中该基因表达不受诱导，而盐 处理的根中该基因表达量提高。SIDP1基因表达模式分析表明，该基因在根、花、萼片及成熟时期果实中表达量较 高。这些结果为进一步研究S1DP1基因在番茄生长发育过程的功能奠定了基础。 关键词 SIDP1基因；生物信息学分析研究；表达模式；激素处理 ；非生物环境胁迫 中图分类号：Q786 文献标志码：A doi：10．7525／j．issn．1673—5102．2014．01．010 Cloning，BioinformaticsandExpressionAnalysisofSIDP1GeneinTomato DU Li—Xin HUZong-Li ZHANGJian—Ling CHEN Guo—Ping (CollegeofBioengineering，ChongqingUniversity，Chongqing 400044) Abstract DP genebelongingtoDP／E2F transcriptionfamily，encodesadimericchaperoninofE2F protein， whichisessentialforregulatingcellcycle，DNA replication，growth，differentiationandapoptosis．Accordingto sequenceregisteredinSNG database，aDP genewasclonedusingRT—PCR，andnamedasS1DP1gene．S1DP1 proteinislocatedinnucleus，containsconservedDNA—bindingdomain，dimerizationdomain，C—terminaldomain andmultiplephosphorylationsites．SIDP1proteinhas51．50％ loop，34．02％ 一helixesand 11．87％ B— strands．ExogenoushormoneanalysismanifestedthatSIDP1genewasinduced byethyleneprecursorACC． ResultsofabioticenvironmentresponseindicatedthatS1DP1genewasnotinducedinleavesunderwoundand saltstress，butwasapparently induced in salt—stressroot． The expression pattern analysisrevealed that expressionofSIDP1genewasstrongerinflower，sepalandmaturefruits．Taken together，ourdataestablish a goodfoundationofrstudyingthebiologicalfunctionsofSIDP1geneintomatolifecycle． Keywords S1DP1gene；bioinformatics；expressionpattern；hormone；abioticenvironmentstres