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AniⅢ丑l Bullctin 373
(Octobcr2006)V01．10No．1 Biotcchnology
河北荷斯坦母牛5个微卫星基因座遗传多态性研究+
方丽1，储明星1，安永福2，叶素成1
保定071000)7
(1．中国农业科学院畜牧研究所，北京100094；2．河北省畜牧兽医研究所，
坦母牛进行了遗|传检测。用非变性(中性)聚丙烯酰睦凝姣电泳柏嘟4微卫星的PCR扩增产物．
异最小。
关键词：荷斯坦母牛；微卫星基因座；遗传多态性
Tandem
联重复(Short Repent，STR)，又称为简单序列重复(SimpleSequenceRepeat，SSR)。普遍存
在于真核生物的基因组中，平均每10kb就出现一个STR。微卫星因数量多、分布广、多态性丰富、呈共
显性遗传方式以及检测快速方便等优点而倍受推崇。分子遗传学的发展为家畜育种工作开辟了一条新的
途径，使得家畜育种工作者从分子水平直接研究基因与性状之间的关系成为可能。本文选择与奶牛产奶
群体中的遗传变异，为奶牛产奶性状的标记辅助选择研究积累分子基础数据。
1材料和方法
1．1样本DNA
90头河北荷斯坦母牛血样采自河北省石家庄三鹿奶牛场，颈静脉采血，10mU头，用ACD抗凝，·20
℃冻存。用酚氯仿抽提法提取基因组DNA，溶于TE中，4℃保存。
1．2引物合成
微卫星引物序列见文献…，由上海生工生物工程公司合成5对引物。微卫星引物序列及来源见表1。
1．3PCR条件
8．0)，
反应总体积为25虬。PcR反应体系组成：IOX扩增缓冲液(10mmol／LTris—HCI(pH
50nⅡnol／LKCl，0．1％TritonX-100)2．5虬、模板DNA
度为1．OVmol／L、TaqDNA聚合酶1U和Mg”(参见表2)。本研究建立的最佳PCR条件见表2。
1．4 PCR结果的电泳检铡和基因型的判定方法
Innotech
896～15％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳适于分辨lOObp～290bp的微卫星DNA。用美国Alpha
公司的凝胶成像系统携带的Alphalmager软件(Version5．1)计算微卫星等位基因大小。
1．5统计指标‘“12】
计算微卫星基因座的等位基因频率、多态信息含量、有效等位基因数和杂合度。
Information
多态信息含量(Polymorphic Content，PIC)的计算公式：
基金项目：“十五”国家重大科技专项资助(课题编号2002BA518AIo)
作者简介：方丽(1962-)，女，助理研究员，研究方向；畜禽育种。E-maillyangfwd@sina．c伽
net
通讯作者：储明星(1908-)，男，博士，研究员，研究方向：分子数量遗传学。E-mail：mxdlu@263
374 第十次全国畜禽遗传标记研讨会论文集
^ ^一1 4
PIC=1一(∑P，2)一(∑∑2P；2P?)
i-1 忙1 J-“-1
其中厅和B分别为第j个和第／个等位基因的频率，口为等位基因数。
有效等位基因数的计算公式：
，z。=1／宝P，：
i=1
，
其中疗为第j个等位基因的频率，n为等位基因数。
杂合度的计算公式：
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