江淮流域家鸭资源系统进化的研究.pdfVIP

10No．1 Animal Bulletin (Octobet2006)Vol Biotcclmology 李慧芳1，张汤杰2，陈宽维1，汤青萍1，高玉时1 (1．中国农业科学院家禽研究所，扬州225003；2．扬州大学兽医学院，扬州225009) 摘要：利用DNA溺l序技术测定了中国江淮流域9个家鸭品种106个个体线粒体DNA控制区多 变序列，序列分析结果显示：检测到34个变异侥占、，约占分析住点总数的5．1％，有转换、颠换、 插～缺失4种类型的变异。确定了31种单倍型，其中单倍型A7为江淮流域家鸭的主体单倍型，品 种之间有9种共享单珥}型。9个家鸭品种单停型多样度O{d)平均为0．798，核苷酸多样度㈣平均为 0．28％，单倍型多样度在荆江寐鸭中最高，其次是做县麻鸭和恩施寐鸭，在丈登震鸭中最慨9个品 种家鸭品种间核苷酸分歧度(脚)约为0．139％～0．433％，品种之间双参数距离范围为0．0014— 0．00433，分子方差分析表明，江淮流域鸭总体E遗传分化不显著，遗传变异i要来自个体之间。31 个江淮流域家鸭单倍型序列的系绒发生分析表明，江淮流域家鸭只有1个母系起源。单4争型网络关 系分析没有发现东亚斑嘴鸭对江淮流域家鸭起源有贡献的证据。 关键词：家鸭；mtDNA控制区；单档型；遗传多样l生 家鸭在动物分类学上属于鸟纲的雁形目，鸭科，河鸭属。我国驯养鸭至少有三千多年的历史，比欧洲最 早记载的养鸭耍早十多个世纪【1】。对于家鸭的起源与演化在学术界历来有两种看法【2司：一是即家鸭是由野 生绿头鸭，长期驯养而来；另—种是认为家鸭由野生绿头鸭和≯田嘴鸭在我国不同地区单独驯养，或由绿头鸭 与》豇劈鸭自然杂交的杂种代驯养而来。 线粒体DNA进化速度快，主要为母系遗传，只需少量个体便能反应群体遗传结构这些优点使得线粒体 DNA广泛应用于起源、分子进化、分类及遗传结构方面的研究。然而有关我国地方鸭种线粒体DNA遗传变 异、起源和分化方面的研究国内还未见有研究报道。长江、蓟可是中华民族文明的两大发源地，畜禽的产业 形态、种类、品种及其演化作为—种文化现旁是伴随着人类的文明而簏展的。江淮流域由于气候温暖龌润， 土地肥沃，雨量充沛，物产富饶，又位于黄河与长江之间，是黄河文化和长江文化的—个交汇地与中转站， 为探讨我国江淮流域鸭种遗传结构和探讨起源与演变过程选取了长江中下游及淮河流域九种国家认定的地 方鸭种进行了研究。 1．材料与方法 1．1样品的采集和DNA提取 选取长江中下游流域和淮河流域的9个地方鸭品种，共采集106份血样，_20℃冰箱保存。采集地的具体 地理位置和样本数见表l。 1．2DNA扩增和序列测定 采用酚氯仿提取总DM，线粒体叭^D-loop扩增所用的引物根据Sorenson等设计的引物重新设计组合， 分别为L78GTTATrTGGTTATGCATATCGTG；H774 PRISM3730测制2t进行测序。 近。所有P僳扩增都在EppendorfMastercycler扩增仪E进行。在ABI 表1试§甜才车斗的来源、数量及地理位置 项目来源：国家科技基础条件平台项目(200SEAEnOI)． 002@yahoo．。o吐cn 通讯怍者：李慧芳(my4●，女’副研究受，研究方向：主要从事家禽遗传育种与爨殖的研充E-roll：HFxF 第十次全国畜禽遗传标记研讨会论文集 13数据处理 hnas 测序结果通过DN^IⅡa116．0．40软件对昕有样本序列排列同源序列，并且与Genihnkplacyrhynchos 属线粒体DNA 软件分别完成统计处理和构建单倍型网络关系图。 2结果 2．1江淮滴_域鸭绒粒体mqAD-loop区部分序列的遗传多态．陛 2．1．1序列的核苷酸多态位点变异 虽稍高于G+C含量，但C含量较高，表现出碱基组成的偏倚|生。本次试验测定了江淮ijf口或9个鸭品种106 条序列，以单倍型A7为标准进