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PBl7
DNA骨架磷硫修饰蛋白DndE结构与生物学功能初步研究
9李芳4吴厚铭I丁建平3,
胡伟M,王呈坤¨,梁晶丹2,张天龙3,胡中培1‘4,王志军3,蓝文贤1
吴更2,邓子新3,曹春阳1+
f1.中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室,中国上海市零陵路345号,上海200032:
2.上海交通大学微生物代谢国家重点实验室,上海200030;3.中国科学院上海生命科学研究院生物化学与
细胞生物学研究所,上海200031;4.华中师范大学,武汉430079)
DNA磷硫修饰是人类发现的第一种生理性的DNA骨架修饰,这种修饰具有序列专一性,
立体选择性,分布广泛性。研究表明,DndE蛋白是控制生理体内DNA磷硫酰化修饰的五
个基因编码的蛋白之一,但是其如何发挥功能还有待进一步研究。借助NMR技术,我们发
现DndE蛋白在Trish缓冲体系中构象均一。在此基础上,我们解析了来自大肠杆菌B7a
中的DndE蛋白的晶体结构,表明DndE蛋白是一种带缺口dsDNA结合蛋白,而不是基于
生物信息学分析所探知的硫转移酶或者三磷酸腺苷水解酶。这也进一步表明,DndE蛋白可
能在DNA磷硫修饰过程中与磷酸化的DNA进行结合,从而发挥着重要的生理作用。DNA
骨架发生断裂产生缺口是DNA磷硫修饰的关键步骤。
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★通讯联系人:曹春阳:电话:02
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220 PBl7
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StructuralintoDndEfromEscherichiacoilB7Ainvolved
insights
DNA modificationrevealsit’SanickedDNA
phosphorothioation
bindingprotein
Wei Lanl,
Wan92,Wenxian
Hul8,ChengkunWan91毫JindanLian92,ljanlongZhan93,ZhongpeiHulA,ZhUun
Wu2,Zixin Ca01卑
FangL:,HoumingWul,JianpingDin93,Geng Den92,Chunyang
of andNaturalProduct Instituteof Chemistry,
(1.StateKeyLaboratoryBio—organic Chemistry,ShanghaiOrganic
Chinese of
Sciences,345 200032,China;
Academy LinglingRoad,Shanghai
ofMicrobial SchoolofLifeSciencesand Jiao
2.Laboratory Metabolism,and
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