利用QSAR模型预测类雌激素化合物的相对效应势.pdfVIP

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第四届全国环境化学学术大会论文集(下册) 利用QSAR模型预测类雌激素化合物的相对效应势 李斐1,陈景文“,王子健2,于海瀛1,葛林科1 16024; 1.大连理工大学工业生态与环境工程教育部重点实验室,环境科学与工程系,大连,l 2.中国科学院生态环境研究中心环境水化学国家重点实验室。北京,100085 关键词:类雌激素效应;重组基因酵母;QsAR;PLs;外部验证 O引言 重组基因酵母检测法是检测类雌激素物质的基础测试方法,其分子生物学原理简单、易于操作, 具有良好的应用前剥¨。然而,逐一检测有机物的类雌激素效应,费时费力,需要各种标样和消耗 品,难以满足有机污染物生态风险评价的需求。尤其对于雌激素效应较弱的物质,现有实验方法检 测限通常较高,可能无法获得其准确的活性值。因此有必要发展有机污染物类雌激素效应的快速估 算方法。由于各实验室间操作过程存在差异,本研究采用类雌激素化舍物的相对效应势(10酣固作为 预测对象,建立了典型有机污染物类雌激素效应的定量结构一活性关系(QSAR)预测模型。 1材料与方法 1.1实验数据 训练集由Coldham等人[21测得的部分数据组成,对应6类物质(类固醇类雌激素、人工合成雌激 素、杀真菌剂、植物雌激素、烷基酚类、卤代芳烃和酞酸酯类)。类雌激素效应采用lo酗甲表示。尉, 定义为: 待测物质) RP=竺ECso(篙斋×100 式中,ECso为半数有效剂量。 本研究根据重组基因酵母检测法测定了一些化合物的兄P值,作为模型的外部验证集,具体实 验方法参照文献【3】。 1.2OSAR模型建立 6.0,UmertriAB 进行初步筛选。采用PLS回归分析建立模型,具体运算由软件Simca-S(Version Erisofl AB)执行。由交叉验证来确定主成分个数。采用所有PLS主成分所解释的因变量方差比例 (∥。卫)、投影重要性指标(D、拟合值的标准偏差(s目以及预测值和实测值的相关系数(固作为模型 的性能评价指标14J。 2结果与讨论 2.1OSAR模型建立 采用DRAGON2.1计算得到709个3D分子描述符,然后按前述方法筛选变量后,对25种化合 物进行PLS回归。通过比较Q2一、艇以及R,选择得到最优模型(1): (1) 玎=25,∥一=o.815,SE=0.229,R=0.943,P0.0001 730 第四届全国环境化学学术大会论文集(下册) 2 2.2模型评价 模型(1)共引入了3个主成分,6个描述符。其l 5 ∥一为o.815,表明具有较好的预测能力和稳健性。 ● 这6个预测变量的VIP值均大于O.5,说明它们对模 型构建有重要贡献(如图1所示)。分析其在各变量上 O5 的载荷,发现原子性质(极化率和范德华体积)是影响 化合物logRP大小的主导因素。 O 模型残差服从均值为0、标准偏差为0.229的正 态分布,说明模型没有系统误差,利用6个分子描 誊§矿誉歹毋 述符能够充分解释logRP值的变异。通过模型的外 图l模型(1)中个变量的V/P值 部验证评价模型的稳定性。IogRP的实测值和预测值 的相关系数尺为0.943,说明预测值和实测值之间具 2 有很好的相关性(如图2所示)。 建立的QSAR模型能够用于预测类雌激素化合 O 物的|og/O值。作为可

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