西洋参达玛烷合酶PqDS1基因的克隆与生物信息学分析.pdfVIP

2012InternationalConferenceon China Ginseng·Jilin P21 西洋参达玛烷合酶eqost基因的克隆和生物信息学分析 郭溆，罗红梅，吴琼，孙超，宋经元，陈士林+ 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所／濒危药材繁育国家工程实验室，北京100193 通讯作者：陈士林，E-mail：slchen@implad．ac．cn。 摘要：目的：克隆植物皂苷生物合成途径中的关键限速酶基因达玛烷合酶(Dammarenediol synthase，DS)， 并对其进行生物信息学分析。方法：本研究根据课题组已获得的西洋参(Panax 化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析。结果：研究结果表明，克隆获得的西洋参DS／基因长为2，310bp， 蛋白结构预测结果表明PqDSl蛋白含有一个跨膜区，不具有信号肽；序列比对和进化关系分析表明西洋参 PqDSl与人参、三七的相似性高，且系统进化关系较近，与植物自然进化关系保持一致。结论：本研究成 功克隆了西洋参PqDSI的全长序列，并对其进行了生物信息学分析，为进一步阐明西洋参皂苷合成代谢途 径奠定基础。 关键词：西洋参；达玛烷合酶；皂苷合成 and ofDammarenediol inPanax Cloninganalysis synthase(PqDSl)genequinquefolius Xu Wu，Chao Chen+ Guo，HongrneiLuo，Qiong Sun，JingyuanSong，Shilin for of Medicinal ofMedicinalPlant ofMedical National Materials,Institute Development，ChineseAcademy EngineeringLaboratoryBreedingEndangered Union 100193，China SciencesPekingMedical，Beijing a in rate—limitingenzyme biosynthetic Abstract：0bjeetive：Dammarenediolsynthase(DS)iskey ginsenoside focusedon and ofPanax study cloninganalysis quinquefolius pathway．This the datasetof P transcriptomefour-year-oldquinquefolius，oneuniquesequenceencoding searching dammarenediolwasdiscovered．Thewere tothe of synthase primersdesignedaccordingtranscriptsequence fromtheP dataset．And theroottotalRNAas open PqDSl quinquefoliust