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2001 22 5 265
16S rRNA
刘佳文 吕红艳 综述 吴雪琼 审校
( 北京胸科医院基础室, 北京 100095)
: 16S rRNA 基因序列高度保守, 其核 酸位点的变化具有种的特异性, 用分子生物学技术分析 16S rRNA 基因, 能够
将分枝杆菌鉴定到种的水平本文就用 16S rRNA 基因进行P CR 扩增DNA 直接测序限制性酶切片段长度多态性( RF LP) 分
析DNA 探针杂交来鉴定分枝杆菌进行综述
: 16S rRNA 基因; 分类鉴定; 分枝杆菌; PCR
: Q522 : A : 1006- 3730( 2001) 05-0265-03
rR NA , A B , 16S rR NA
[ 14]
r RNA 5- 16S-23S-5S- 3, 16S rRNA
( internal tran cibed pacer IT S )
1 PCR-
16SrDNA23SrDNA 5SrDNA RNA ,
这种方法的基本过程是, 先P CR 扩增 一模板DNA, 然后
16S23S 5S rRNA 16S rR NA 对扩增片段进行测序测序后或人工解读, 或使 测序数据
, 16S rRNA 分析软件包自动解读测序的正反链序列经校正后可排列
, 成 一个一致序列( con en u equence) 将被检分枝杆菌的 一
致序列中的特征性序列和已知分枝杆菌的特征性序列进行比
, , 16S rRNA 较, 就可以准确地鉴定这种分枝杆菌或者通过计算机从
1 500bp, EM BLDDBJPDBGenBank 和 Ribo omal Databa e library
16S rR NA[ 12] ( w ww . cme. m u. edu/ RDP) 等数据库寻找DNA 序列相似度
16S rRNA , A 只有当被检分枝杆菌的相关序列和数据库的参考序列 100%
[ 45]
10( helix 10) , B 18( helix 18) 相同时, 才可以作确切的鉴定 目前常 于测序数据分析
16S rR NA 的软件包有, 如DNA-SI S vi ion7 软件, M icr oSeq oftware vi ion
[ 45]
A ( ig natur e equence) , 1. 36 等 排列测序后的DNA 序列的软件包有多序列排列
, 法( multi equence alignment algorit hm) 软件包SAGE( T echno-
[ 3]
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