革胡子鲶生长激素cDNA克隆和蛋白质结构分析.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2008 7 , 30(7): 913―918 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2008.00913 cDNA 1,2 1 1 1 1 1 杨学明 , 何荆洲 , 黄雄军 , 李芳芳 , 郭亚芬 , 蒋和生 1. , 530005; 2. , 530021 : 从革胡子鲶(Clarias lazera(Burchell)) 的脑垂体组织中提取总RNA, 应用 RT-PCR 方法, 扩增得到了革胡 子鲶生长激素(Growth hormone, GH)基因cDNA 的开放阅读框(Open reading frame, ORF)序列。ORF 全长为603 nt, 编码由 22 个信号肽氨基酸和 178 个成熟肽氨基酸共同组成的生长激素前体蛋白。序列同源比较结果表明, 研 究中得到的革胡子鲶生长激素氨基酸序列与 GenBank 中已报道的其他6 种鲶形目鱼类的氨基酸序列同源性高 达95.8% 。二级结构预测分析结果表明, 革胡子鲶生长激素蛋白中含有α 螺旋、β 折叠和β 转角以及无规卷曲等 二级结构, 以α 螺旋为主, 是典型的α 型结构蛋白质。此外, 抗原性分析表明, 在氨基酸序列中的4 个区域均可 形成优势抗原表位, 其结构特点非常适合改造成为重组生长激素疫苗或单克隆抗体制剂加以开发利用。 : 革胡子鲶; 生长激素; cDNA 克隆; 二级结构 cDNA cloning and protein structure analysis of growth hormone from Clarias lazera 1,2 1 1 1 1 YANG Xue-Ming , HE Jing-Zhou , HUANG Xiong-Jun , LI Fang-Fang , GUO Ya-Fen , JIANG He-Sheng1 1. College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning 530005, China; 2. Guangxi Fisheries Institute, Nanning 530021, China Abstract: Total RNA was isolated from pituitary gland of Clarias lazera, and the cDNA encoding growth hormone (GH) protein was amplified and cloned by reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR). The open reading frame (ORF) of cDNA is of 603 nt which encodes GH precursor consisted of a signal peptide with 22 amino acid residues and a mature peptide with 178 amino acid residues. Sequence alignment indicated that the amino acid sequence homology ap- proached to 95.8% between