Cohaesibacter+yellowgenesis+sp．nov.一株从海参养殖池底泥中分离到新种微生物.pdfVIP

Cohaesibacteryellowgenesissp．nov．，-一株从海参养殖池底泥中分离到的新 种微生物 曲凌云1赖其良2朱风玲1孙修勤1邵宗泽2 (1国家海洋局第一海洋研究所 2国家海洋局第三海洋研究所) (0532ly@fio．org．en) 摘要：DQHS21T是从青岛即墨一海参养殖池底泥中分离到的细菌．16S序列比对显示该菌与现有 CL．GRl5T相似性最高，但仅为96．4％，与其它现有纯培 纯培养的菌株Cohaesibactergelatinilyt．icus 养菌株的16S序列相似性均低于93％．其菌体脂肪酸主要组分为c18：l ％)，Ci6：0(9．31％)，C18：l∞7c 菌体总脂肪酸含量的95．6％．生理生化学研究显示该菌G阴性，接触酶氧化酶特性均为阴性．基因 名为Cohaesibacteryellowgenesissp．nov．(菌种保藏编号为CGMCCl．9157)． 微生物是一群个体微小，但种类丰富的生物。长期以来，人们利用纯培养技术对环境中的微生 物进行调查研究和开发利用．但是，研究表明我们目前了解和认识到的微生物只占总数的1—5 ％，自然界中绝大多数微生物(95％以上)尚不能或尚未被目前的纯培养技术所培养，但是他们 以我们不了解的方式在维持着我们地球生态圈的稳定，我们在实际生活和生产中利用的微生物不 到千分之一．为了更准确、广泛地研究环境中的微生物，随后不采用培养手段，而利用分子生物 学技术和手段，例如宏基因组学(Metagenomics)的方法来获取不可培养微生物的基因资源．这类 方法的应用极大地推动了对自然界中微生物功能资源的开发和应用，但是仍然没有克服微生物不 可培养所导致的根本弊端．因为，这些方法不以获取微生物活体细胞为目的，致使无法准确了解 微生物细胞的生命活动以及微生物群落中各种微生物相互协调的规律，进而无法对环境微生物工 艺进行准确地设计、精细地调控和高效地利用．因此，在利用分子生物学技术手段研究微生物和 微生物群落，开发微生物基因资源的同时，需要大力开发微生物培养技术，以提高微生物可培养 性，尽可能培养微生物． 因为微生物资源对于科技研究和生物产业的重要性，因此世界上许多国家都在搜集、保存各 种微生物资源．根据最新的统计资料，在68个国家和地区分布了551个保藏中心，这里面一共保存 了142万种以上微生物品种，在这些已经被人类保存的微生物品种里面有70％以上超过100万株保 存在欧美。日本这样的发达国家．我国微生物资源搜集保存工作也蒸蒸日上，比如微生物资源中 库，保藏量居国际保藏中心前10名；海洋微生物资源整理．整合与共享平台目前搜集整理了接近 12000株海洋微生物．这些资源及在未来的不断丰富将为我国生物技术的发展奠定坚实的物质基 础．本文报道了一株分离自海参养殖环境底泥中的细菌新种的分离和鉴定的研究工作． 同一环境样品用不同的分离培养基和分离程序得到的微生物菌株可能存在很大差异．在本研 究中，我们针对取tl青岛即墨某一海参养殖池(水深10m，120．82E，36．50N)的底泥样品进行了细 菌分离．将底泥样品用两种方法处理，一是底泥样品按常规用3％盐水稀释后取上清直接涂布 2216E固体培养基一是将底泥样品在厌氧环境下进行富集后分另0用在厌氧和好氧条件下进行分离纯 化．基于某些未知原因，底泥样品经过上述方法处理后，直接涂布于2216E固体培养基获得的菌株 与已知菌株相似性均较高(17株，均98％以上)，而经过厌氧富集后涂布于2216E固体培养基获得 的菌株与已知菌株相似性平均较低(2l株，6株低于98％，其中三株分别为97％，96．4％，90％)． 23 DQHS21为一株与已知茵同源相似性较低的细菌，该菌株16S序列比对显示其与现已纯培养的菌株 Cohaesibacter CL．GRI Yeon and Cheol 5T(ChungHwangByung Cho，2008)相似性最 gelatinilytieus 高，但仅为96．4％，与其它现有纯培养菌株的16S序列相似性均