应用肿瘤基因芯片筛选早期肺鳞癌相关基因.pdfVIP

· 1496· 中国病理生理杂志 ChineseJournalofPathophysiology 2008，24(8)：1496—1500 [文章编号] 1000-4718(2008)08—1496—05 应用肿瘤基因芯片筛选早期肺鳞癌相关基因水 刘 丽 ， 杨 勤M， 黄 薇 ， 吴 倩 ， 杨 婷 ， 何 常 ， 冉 鹏 ， 凌 锋 (贵阳医学院。病理生理学教研室，病理学教研室，附属医院胸外科，贵州 贵阳550004) [摘 要] 目的：研究人早期肺鳞癌发生相关基因表达谱，探讨肺鳞癌发生的分子机制。方法：选取人早期 肺鳞癌组织以及相应正常组织，提取RNA，与含480个与肿瘤相关基因的芯片杂交，结果经SuperArrayImage软件 分析后比较两种组织中的差异表达基因。结果：共筛查出差异表达基因 192条，其中表达上调基因 127条，下调基 因65条；按照基因功能可分为运输载体、代谢相关基因、细胞信号转导分子、细胞骨架、转录调控因子基因。结论： 基因芯片可用于早期肺鳞癌相关基因表达谱的筛查，可为明确早期肺鳞癌发生机制提供重要参考。 [关键词] 肺肿瘤；基因表达谱；寡核苷酸序列分析 [中图分类号] R363 [文献标识码] A Detectionofassociated genesin humanlungsquamouscellcarcinomain earlystagewithtmu orcDNA microarray LIULi，YANGQin，HUANGWei，WUQian，YANGTing，HEChang，RAN Peng’．LING Feng’ (DepartmentofPathophysiology，DepartmentofPathology，DepartmentofThoracicSurgery，TheAffiliatedHospital， CuiyangMedicalCollege，Guiyang550004，China．E—mail：qinyang@gme．edu．ca) [ABSTRACT] AIM：Toinvestigatethegeneexpressionprofileofhumanlungsquamouscellcarcinomaineraly stage．METHODS：ThemRNAwasextractedfrom cancertissueandnormallungtissue．Themixedprobeswerelabeled andhybridizedwithchipcontaining480cracinomarelatedgenes，thenanalyzedbySuperArrayImagesoftwraetostudythe geneexpressionpatternsinlungsquamouscellcracinoma．RESULTS：192genesassociatedwithlungsquamouscellCra- cinogenesiswerefound，whichweregroupedintotrna sporter，adhesionmolecules，cytoskeletonproteins，transcriptionreg- ulator，genesassociatedwithmetabolism andimmuneresponseaccordingtofunctions．127genswerepo sitivetolungsqua- mouscellcarcinogenesisna d65geneswerenegativetolungsquamouscellcracinogenesis．CONCLUSION ：Th escreenof geneexpressionprofileofhuman lungsquamouscellcracinomaprovidesvaluableinfomr ationforthereserachofmolecular mechanism ofthelungsquamouscellcracinogenesis． [KEYWORDS] Lungneoplasms；Geneexpressionprofiling；Oligonucleotidearrays