鼻咽癌候选侵袭和转移相关基因的筛选.pdfVIP

广东药学院学报 JournalofGuangdongPharmaceuticalCollege Feb．2011，27(1) 鼻咽癌候选侵袭和转移相关基因的筛选 刘真 ，方唯意。 (1．广州医学院 病理教研室，广东 广州 510182；2．南方医科大学 肿瘤研究所 ，广东 广州 510515) 摘要：目的筛选影响鼻咽癌侵袭和转移能力的相关基因。方法 利用cDNA基因芯片，比较高转移鼻咽 癌细胞株 5_8F和非转移鼻咽癌细胞株 6-10B之间的差异表达基因，并利用在线Milano程序筛选鼻咽癌 侵袭和转移相关基 因，GOstat分析这些基 因功能，最后荧光定量 PCR鉴定差异表达基因。结果 芯片分 析结果显示 ，鼻咽癌细胞株 5—8F与6-10B之问共有 200多个差异表达基因。基于Milano程序分析后， 发现与侵袭和转移能力相关的基因有33个，其中27个上调 ，6个下调。GOstat分析显示，这些基因参与 了细胞移动、调节凋亡、细胞黏附等。结论 经在线 Milano程序分析鉴定的鼻咽癌 5—8F和 6-10B细胞株 之间的这33个差异表达基因可能参与了鼻咽癌的侵袭和转移。 关键词：鼻咽癌；基因芯片；侵袭和转移能力 中图分类号：R739．63 文献标识码 ：A doi：l0．3969／j．issn．1006-8783．2011．01．021 文章编号 ：1006—8783(2011)01—0081—05 Screeningofpotentiallyinvasiveandmetastaticgenesin nasopharyngealcarcinoma (NPC) LIU Zhen ，FANG Wei—yi (1．DepartmentofPathology，GuangzhouMedicalCollege，Guangzhou，Guangdong510182，China； 2．CancerResearchInstitute，SouthernMedicalUniversity，Guangzhou，Guangdong510515，China) Abstract：ObjecfiveToscreenpotentialgenesassociatedwithinvasionandmetastasisinnasopharyngeal carcinoma．M ethodscDNA microarraywasusedtodetectthedifferentialexpressionin5-8Fcellswiththe abilityofhighmetastasisand6-10Bcellslackingthemetastaticability．Subsequently，genesofinvasiveand metastasiswerescreenedbyMilano softwaretoo1．Thefunction ofthesegeneswasanalyzedbyGOstat program ．And real—time PCR wasutilized to confirm the reliability ofdifferentially expressed genes． ResultsMorethan200 geneswereidentified tohavethedifferentialexpression．Aftertheanalysiswith Mllanosoftwaretoo1．33geneswerefoundtobelikelyassociatedwithcellinvasionandmetastasis．Among thesegenes，27geneswereshowedtobeupregulated，and6geneswereindicatedtobedownregulated． Finally，thereliability ofdifferentially expressed geneswasconfimr ed byreal—timePCR．Conclusion DifferentiallyexpressedgenesshowninNPC5-8Fcellscomparedto6-10B cellswiththeidentificationof onlineMilanoprogram analysiswerelikelyassociatedwiththeinvasionandmetastasisofNPCcell