新型猪细小病毒(PPV4)TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立与应用.pdfVIP

新型猪细小病毒(PPV4)TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立与应用.pdf

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病毒病一猪其他病毒病 殖与呼吸综合征病毒,猪瘟病毒,猪圆环病毒2型、猪细环病毒和猪源牛病毒性腹泻病毒均为阴性;批内及批间变 异系数均低于2%。用建立的荧光定量PcR方法对30l份临床病料感染情况进行检测,结果首次在我国猪群中检测 到PPv4,阳性率为3.32%,而普通PcR检出率仅为2.66%,且两种方法的符合率为loo%。结果表明,建立的检测 方法为PPw的检疫,分子流行病学调查以及敏感细胞的筛选等提供了新的快速检测技术. 关键词猪细小病毒4型;TaqMan荧光PcR;检测 PPV于1967年由 猪细小病毒(PPV)一直是危害猪群繁殖性能的主要传染性疾病之一。 Cam嘶蛳首次在不孕、流产、死胎母猪中分离到,并证实了其病原作用:引起猪繁殖障碍,除怀 孕母猪外,其他类型的猪感染后均无明显的临床症状。猪细小病毒还常和呼吸与繁殖障碍综合征病 毒(PRRSV)、圆环病毒(PcV)、伪狂犬病毒(PRV)混合感染,造成猪的繁殖障碍,给养猪业带来 霞人的经济损失。目lj{『研究认为,除r普通的PPV外,临床上还在多种PPV不同致病株和其他基因 型。 美国科学家存2009年新近检测到的新型细小病毒,该病毒基冈组基凶组约为5905bp,包含3个读码框 架。目前暂时将其归入细小病毒科(p口vDv们砌e)细小病毒亚科(砌M肮缸P)细小病毒属 仞口,.阳v砌s)HJ。国内除了普通猪细小病毒,PPVl的报道之外,其他二型均未有报道。因此,及时开 展PPV4的相关研究具有犀要的应用价值。 近年来广泛应用于临床病料检测的荧光PcR不仅具有灵敏性高、特异性强、用时短等优点,而 H.可以对枪测进行实时监控,检测结果直观准确。许多动物病毒都相继报道用Real.tiInePCR方法来 检测p嗡J。因此,本寅验在已公布的PPV4序列基础卜设汁引物和探针,通过优化反应体系和反应 条件,建立了基于TaqMan探针的猪细小病毒4型荧光定量PCR方法,并应用该方法检测广我国PPV4 流行情况,以及应用定量PC砌莲行了PPV4的部分敏感细胞的筛选上作。 1材料和方法 1.1毒株与阳性病料 市的猪群的发病猪临床病料,均由本实验室收集、分离、鉴定和保存。 1.2仪器和试剂 主要仪器有Eppendorf公司的Realplex4荧光定胃=PCR仪,ABI梯度VeritiPCR仪,Nanodrop DNA聚合酶 HS (DRR002B); Taq 1.3引物和探针的设计合成 保守序列设计引物和TaqM肌探针,设计的卜游引物为5’.TGGTGGTC. AAGTATCTGTGCC.3’, 下游引物为5’.TTGCTTTTGGATGTCC.TGGT一3’,探针序列 1.4病毒DNA的提取 组织样品研磨液与血清样品反复冻融3次后离心吸,卜清液用于病毒核酸提取,采用天根公司的 病毒DNA提取试剂盒,病毒核酸的提取按照说明节进行。 1.5普通PCR反应 10×Bu虢r mMdNTPs PCR总体系为20HL,其中死g 2此,2.5 2此,上、下游引物(10“M)各0.5 min,95℃30S。 肛,砌gDNA聚合酶0.5肚,模板l此,余下用火菌ddH20补足。反应条件为95℃5 53℃30S,72℃15S,进行35个循环最后72℃延伸10min。反应结束后,产物于2%琼脂凝胶中电泳 鉴定。 第四次猪病学术研讨会会议论文集 1.6质粒标准阳性模板的制备 1.6.1 VP2基因的扩增 , 2.5 mMdNTPs VP2F 缓冲液5止, 4此, LA.忍g酶5U,引物(10心D min后,95℃30s、60℃30s、72℃2lIlin

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