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菌株及质粒
常用菌株一览表
BL21(DE3) 该菌株用于高效表达克隆于有T7噬菌体启动子的表达载体的基因。T7噬菌体RNA聚合酶位于噬菌体DE3区,该区整合于BL21的染色体上。天然缺失外膜蛋白酶ompT和ATP依赖的蛋白酶Lon(La),利于异源蛋白的表达。在培养皿上的生长时间约为10小时左右。
ER2566 该菌株用于高效表达克隆于有T7噬菌体启动子的表达载体的基因。在培养皿上的生长时间约为10小时左右。
DH5α 一种用于铺制与培养质粒平板和粘粒平板的重组缺陷的抑制型菌株。其 80lacZΔM15基因的产物可与pUC载体编码的β-半乳糖苷酶氨基端实现α互补,即可以用于蓝白斑显示。该菌株也缺失多种蛋白酶,在培养皿上的生长时间约为12小时左右。
JM101 一种可支持带有琥珀突变的载体生长的宿主菌,在培养皿上的生长时间约为10小时左右。
JM109 一种带有琥珀突变的载体生长的重组缺陷的抑制型菌株,对转染的DNA有修饰作用但无限制作用,在培养皿上的生长时间约为10小时左右。
HB101 一种通常用于大规模制备质粒的抑制型菌株,它是一种转化效率很高的大肠杆菌K12×大肠杆菌B的杂交菌株,在培养皿上的生长时间约为10小时左右。
常用原核表达质粒一览表
质粒
名称 实验室
系列数 启动子 大小
(Kb) 抗性
标记 融合蛋白
大小(kD) 诱导物 pRSET 3 T7 2.9 Ap 3-5 kD IPTG p24B11 1 T7 5.4 Kan 0-1 kD IPTG pTYB 4 T7 7.3 Ap 55 kD IPTG pGEX 6 Ptac 4.9 Ap 26 kD IPTG pET 2 T7 4.7 Kan 3-4 kD IPTG pTRX-Fus 1 PL 3.5 Ap 11 kD Trp pBV 2 PL / Ap / 420C pMAL 2 Ptac 6.7 Ap 43 kD IPTG
如何提高目的蛋白在大肠杆菌中的表达量及可溶性表达?如何防止目的蛋白的降解?
融合蛋白的表达水平主要受目的蛋白影响、密码子不适、疏水性强、mRNA降解、或由于蛋白错误折叠而水解都可能造成表达水平低,可尝试不同的生长和表达条件来提高融合蛋白的表达量,低温诱导可降低包含体的形成及避免水解;运用最适密码子可提高表达;也可能由于目的蛋白对宿主细胞有毒性而使克隆不稳定。故表达时可利用丰富的培养基、新鲜的单菌落、低温诱导、低浓度的IPTG、减少诱导时间等条件来提高蛋白及可溶性蛋白的产量。蛋白酶抑制剂,蛋白酶缺陷的工程菌或者低温诱导可防止目的蛋白降解,纯化时为防止降解可使用变性条件,如6M脲等。
pMAL纯化系统
pMAL-p2为分泌型表达载体, 表达的融合蛋白分布于大肠杆菌外周腔,用冷渗透法即可获得较纯的融合蛋白。pMAL-c2表达的可溶性融合蛋白多位于大肠杆菌细胞质中,可按常规方法进行纯化。 二者均为Ptac启动子,大小约为6.7Kb, 唯一不同的是pMAL-c2 无malE 信号序列。MBP的分子量为43KD。介质――amylose resin,与麦芽糖的结合能力大于3mg/ml。
pMAL-p2的纯化
用1L的培养基表达目的蛋白, 离心后用400ml的30mM Tris-HCl, 1mM EDTA, 20%蔗糖pH8.0的缓冲液悬浮, 室温下轻轻摇动5-10min。
4℃,8000g离心20min,弃去上清,加入400ml冰预冷的含5 mM MgSO4柱缓冲液悬浮,冰浴摇动10min。
4℃,8000g离心20min,上清即为冷渗透的溶液。
在上清中加入8ml的1M Tris-HCl (pH7.4)。
用8倍体积的柱缓冲液平衡介质。
上样, 结合30min。
用12倍体积的柱缓冲液平衡介质
用3ml的洗脱缓冲液(含10mM的麦芽糖的柱缓冲液)洗涤多次(10-20次), 一般情况下目的蛋白集中在前5个收集峰中。
pMAL-c2的纯化
用1L的培养基表达目的蛋白, 离心后用40ml的柱缓冲液悬浮。
超声处理样品, 离心后收集上清。
以下方法按pMAL-p2的步骤5--8进行。
所需培养基及缓冲液
①丰富培养基 每升中含10g tryptone
5g yeast extract
5g NaCl
2g glucose
②colume buffer: 20mM Tris-HCl ( pH7.4 )
200mM NaCl
1 mM EDTA
③elution buffer: col
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