荞麦不同种问BW10KD过敏蛋白基因序列比较.pdfVIP

广东农业科学 2013年第 9期 荞麦不同种问BWIOKD过敏蛋白基因序列比较 陈晴晴，石桃雄，陈庆富 (贵州师范大学生命科学学院植物遗传育种研究所／荞麦产业技术研究中心 ，贵州 贵阳 550001) 摘 要：养麦过敏蛋白(BW10KD)与变应原病人的血清免疫球蛋 白(immunoglobulin E，IgE)有强烈反应。通过对属于 8个养麦 种和 1个变种的 58个收集系中的 BW10KD过敏蛋白基因保守片段进行差异分析与系统进化关系研究 ，为探讨 BW10KD基因的 结构功能及其在不同种间的进化奠定了基础，并为发生在物种基因 DNA水平的微尺度的变异与进化研究中提供新的分析方法。 用设计的特异引物进行扩增 ，所得序列与已报道过敏蛋白编码基因序列相似性达 99％。各收集系间进行序列比对 ，得到 307个排 列位点(不含缺失位点)，其中单型不变位点 150个 ，多态位点 S为 157个(含简约信息位点数 101个和单型可变位点 56个)。整个 序列突变位点 Eta为 201个。选择特定分类群内变异小 、分类群间变异大的 19个位点进行系统聚类分析得到清晰的种系关系图。 金荞 、细柄野荞 、硬枝万年荞聚在一起 ，暗示其具有较保守的 BW10KD过敏蛋白基因序列；栽培甜荞与野甜 荞亲缘关系近，其次与 左贡野养较近缘；毛野荞与大野养彼此较近缘 ；栽培苦荞与野苦荞亲缘关系最近，与毛野养和大野荞亲缘关系次之。 关键词：荞麦；过敏蛋 白基因；序列分析；系统发育 中图分类号：Q754 文献标识码 ：A 文章编号：1004—874x(2013)09—0133—07 Comparison of BW IOKD allergen protein gene sequences among different buckwheat species CHEN Qing-qing，SHI Tao-xiong，CHEN Qing—fu (Institute ofPlant Genetws and Breeding,School ofLife Sciertees，Guizhou Normal University／ Research CenterofBuckwheatIndustry Technology,Guiyang 550001，China) Abstract：Buckwheat allergy protein (BW10KD)has a s~ong reaction to allergic patients serum IgE．The objectives of this study were tO deposit information on structure and function of BW10KD gene and evolution possibility of diferent species，and to provide a new method for analyzing DNA variation occurred in diferent species．The conserved sequence of BW10KD gene was amplifed in 58 buckwheat entries fFagopyrum Mil1)belonging to 8 species and a variant species．，I’}le phylogenic trees were constructed according to sequence blast results．The amplifed sequence sharing 99％ homology to the known sequence of allergy protein gene．A total of 306 arrangement sites were identifed in the 58 entries，excluding deletion and insertion loci．Among them，there were 150 invariable (monomorphic)sites and 157 polymorphic(segregating)sites，including 101 parsimony informative sites and 56 singleton variable sites． There were 201 matations on Eta site in the whole sequence．Based on data of 19 sites with small variation within taxa an