基于SSR标记贵州古茶树资源的遗传多样性分析及指纹图谱构建.pdfVIP

2016 年29 卷3 期 萄街农Jt.学报 Vol29 No. 3 Southwest China Joumal of Agricultural Scienc回 491 文章编号:1001 -4829(2016)03 -0491 -07 DOI: 10. 16213/j. c地i. scjas. 2016. 03. ∞5 基于 SSR 标记贵州古茶树资源的 遗传多样性分析及指纹图谱构建 郭燕，刘声传\曹雨，赵华宫，魏杰，都东海，周富裕 (贵州省农业科学院茶叶研究所，贵州贵阳 55α脱) 摘 要:为了贵州古茶树资源的有效保护和充分利用提供理论依据，采用 EST-SSR 标记对40 份贵州古茶树资源进行了遗传多样 性分析和分子指纹鉴定。结果表明 :20 个 SSR 标记在40 份资源中共检测到 76 个等位基因，平均每个标记 3.8 个， PIC 和 Shannon 信息指数平均值分别为 0.462 和 0.936 ，多态性适中。 76 个等位基因在参试古茶树资源中的出现频率差异较大，变异范围为1. 32 % -89.74% 。参试材料的 Neis 遗传距离(D) 为 0.075 -0.875 ，当 D=0.160 时，40 份古茶树资源可聚为6 类，包括3 个单独聚类 和 3 个复合聚类。利用 4 个核心标记即可鉴定40 份古茶树资源，并根据等位基因带型，获得 18 位数的分子指纹图谱号码，构建每 份资源的分子指纹图谱。 关键词:古茶树资源;SSR; 遗传多样性;指纹图谱;贵州 中图分类号:557 1. 1 文献标i只码:A Analysis of Genetic Diversity and Construction of Molecular Fingerprinting with SSR Markers for Ancient Tea Germplasms in Guizhou GUO Yan，口U Sheng-chuan. , CAO Yu , ZHAO Hua-缸， WEI Jie , YAN Dong-hai , ZHOU Fu-归 (Tea Re回皿h Insti!u饵， Guizhou Academy of Agricultrural Sciences , Gui动。u Guiy叫 Abstract: In order to effectively conse凹e and re翩。nably utilize the ancient t国 germplasms in Guizhou , the genetic diversity and molecular fingerprinting of 40 ancient tea plants , collected from the various ecological are翩。f Guizhou , were analyzed using EST-SSR marker. 币le re- sults showed that total 76 alleles were found using 20 SSR markers with a m曲n value of 3.8. The average values of PIC and Shannon s in- formation index were 0.462 and 0.936 r它spectively ， indicating the t回ted germplasrns with moderate level of diversity. 币le ∞currence 如 甲Jency of 76 alleles differed largely , and it ranged from 3. 57 % to 89. 29 %.四e Nei毡 genetic dist